Paquet : sniffles (1.0.12b+ds-1)

Liens pour sniffles

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Ressources externes :

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Paquets similaires :

structural variation caller using third-generation sequencing

Sniffles is a structural variation (SV) caller using third-generation sequencing data such as those from Pacific Biosciences or Oxford Nanopore platforms. It detects all types of SVs using evidence from split-read alignments, high-mismatch regions, and coverage analysis.

Autres paquets associés à sniffles

dépendances

recommandations

suggestions

enhances

dep: libbamtools2.5.1 (>= 2.5.1+dfsg)

bibliothèque dynamique de manipulation de fichiers BAM (alignement de génomes)
dep: libc6 (>= 2.29)

bibliothèque C GNU : bibliothèques partagées
un paquet virtuel est également fourni par libc6-udeb
dep: libgcc-s1 (>= 3.0)

bibliothèque de prise en charge de GCC
dep: libgomp1 (>= 4.9)

bibliothèque GCC pour OpenMP (GOMP)
dep: libstdc++6 (>= 5.2)

bibliothèque standard C++ de GNU v3

sug: bwa

dispositif d'alignement Burrows-Wheeler

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Architecture	Taille du paquet	Espace occupé une fois installé	Fichiers
amd64	703,3 ko	1 100,0 ko	[liste des fichiers]