Balík: r-bioc-rsamtools (2.18.0+dfsg-1 a iné)

Odkazy pre r-bioc-rsamtools

Zdroje Debian:

Stiahnuť zdrojový balík r-bioc-rsamtools:

Správcovia:

Externé zdroje:

Domovská stránka [bioconductor.org]

Podobné balíky:

GNU R binary alignment (BAM), variant call (BCF), or tabix file import

This package provides an interface to the 'samtools', 'bcftools', and 'tabix' utilities for manipulating SAM (Sequence Alignment / Map), binary variant call (BCF) and compressed indexed tab-delimited (tabix) files.

Ostatné balíky súvisiace s balíkom r-bioc-rsamtools

závisí

odporúča

navrhuje

vylepšuje

dep: libbz2-1.0 [nie hppa, m68k, sh4, sparc64, x32]

kvalitná knižnica na komprimáciu súborov s triedením blokov - dynamická knižnica
dep: libc6 (>= 2.15) [m68k, sparc64]

knižnica GNU C - zdieľané knižnice
tiež virtuálny balík poskytovaný balíkom libc6-udeb

dep: libc6 (>= 2.34) [nie alpha, ia64, m68k, sh4, sparc64]

dep: libc6 (>= 2.37) [sh4]
dep: libc6.1 (>= 2.34) [alpha]

knižnica GNU C - zdieľané knižnice
tiež virtuálny balík poskytovaný balíkom libc6.1-udeb

dep: libc6.1 (>= 2.37) [ia64]
dep: libcurl4 (>= 7.18.0) [alpha, hppa, ia64, sh4, x32]

jednoducho použiteľná klientská knižnica na prenos URL (OpenSSL)
dep: libcurl4t64 (>= 7.18.0) [amd64, arm64, mips64el, ppc64, ppc64el, riscv64, s390x]

jednoducho použiteľná klientská knižnica na prenos URL (OpenSSL)
dep: libgcc-s1 (>= 3.0) [amd64, arm64, mips64el, ppc64, ppc64el, s390x, x32]

podporná knižnica GCC

dep: libgcc-s1 (>= 3.4) [alpha, riscv64]

dep: libgcc-s1 (>= 4.2) [ia64, sh4]
dep: libgcc-s4 (>= 4.1.1) [hppa]

podporná knižnica GCC
dep: libgcc1 (>= 1:3.4) [sparc64]

Balík nie je dostupný
dep: libgcc2 (>= 4.2.1) [m68k]

Balík nie je dostupný
dep: libgomp1 (>= 4.2.1) [m68k, sparc64]

podporná knižnica GCC OpenMP (GOMP)
dep: liblzma5 (>= 5.1.1alpha+20120614) [nie hppa, m68k, sh4, sparc64, x32]

komprimačná knižnica formátu XZ
dep: libstdc++6 (>= 11) [nie m68k, sparc64]

štandardná knižnica C++ GNU v3

dep: libstdc++6 (>= 5.2) [m68k, sparc64]
dep: libunwind8 [ia64]

nnižnica na určenie na určenie postupnosti volania programu - dynamické súbory
dep: r-api-3.4 [m68k]

Balík nie je dostupný
dep: r-api-3.5 [sparc64]

Balík nie je dostupný
dep: r-api-4.0 [nie m68k, sparc64]

virtuálny balík poskytovaný balíkom r-base-core
dep: r-api-bioc-3.16 [x32]

Balík nie je dostupný
dep: r-api-bioc-3.18 [nie m68k, sparc64, x32]

virtuálny balík poskytovaný balíkom r-bioc-biocgenerics
dep: r-api-bioc-3.8 [sparc64]

Balík nie je dostupný
dep: r-base-core (>= 3.4.2-2) [m68k]

jadro GNU R na štatistické výpočty a grafický systém

dep: r-base-core (>= 3.5.2-1) [sparc64]

dep: r-base-core (>= 4.2.2.20221110-1) [x32]
dep: r-bioc-biocgenerics (>= 0.1.3) [m68k]

generic functions for Bioconductor

dep: r-bioc-biocgenerics (>= 0.25.1) [nie m68k]
dep: r-bioc-biocparallel

BioConductor facilities for parallel evaluation
dep: r-bioc-biostrings (>= 2.37.1) [m68k]

GNU R string objects representing biological sequences

dep: r-bioc-biostrings (>= 2.47.6) [nie m68k]
dep: r-bioc-genomeinfodb (>= 1.1.3)

BioConductor utilities for manipulating chromosome identifiers
dep: r-bioc-genomicranges (>= 1.21.6) [m68k]

BioConductor representation and manipulation of genomic intervals

dep: r-bioc-genomicranges (>= 1.31.8) [nie m68k]
dep: r-bioc-iranges (>= 2.13.12) [nie m68k]

GNU R low-level containers for storing sets of integer ranges

dep: r-bioc-iranges (>= 2.3.7) [m68k]
dep: r-bioc-rhtslib (>= 1.99.3) [nie m68k, sparc64]

HTSlib high-throughput sequencing library as GNU R package
dep: r-bioc-s4vectors (>= 0.13.8) [m68k]

BioConductor S4 implementation of vectors and lists

dep: r-bioc-s4vectors (>= 0.17.25) [nie m68k]
dep: r-bioc-xvector (>= 0.15.1) [m68k]

BioConductor representation and manpulation of external sequences

dep: r-bioc-xvector (>= 0.19.7) [nie m68k]
dep: r-bioc-zlibbioc [nie m68k]

(Virtual) zlibbioc Bioconductor package
dep: r-cran-bitops

balík GNU R implementujúci operácie po bitoch
dep: zlib1g (>= 1:1.2.3.3) [nie hppa, sh4, x32]

komprimačná knižnica - dynamická verzia

rec: r-bioc-shortread

GNU R classes and methods for high-throughput short-read sequencing data
rec: r-cran-runit

GNU R package providing unit testing framework

sug: r-bioc-biocstyle [nie m68k, sparc64]

standard styles for vignettes and other Bioconductor documents
sug: r-bioc-genomicalignments

BioConductor representation and manipulation of short genomic alignments
sug: r-bioc-genomicfeatures

GNU R tools for making and manipulating transcript centric annotations
sug: r-bioc-shortread (>= 1.19.10) [nie sparc64]

GNU R classes and methods for high-throughput short-read sequencing data
sug: r-cran-knitr [nie m68k, sparc64, x32]

balík GNU R na dynamickú tvorbu zostáv pomocou Literate Programming
sug: r-cran-runit [nie sparc64]

GNU R package providing unit testing framework

Stiahnuť r-bioc-rsamtools

Stiahnuť pre všetky dostupné architektúry
Architektúra	Verzia	Veľkosť balíka	Nainštalovaná veľkosť	Súbory
alpha (neoficiálny port)	2.18.0+dfsg-1+b1	3,499.6 kB	5,779.0 kB	[zoznam súborov]
amd64	2.18.0+dfsg-1+b1	3,500.1 kB	5,581.0 kB	[zoznam súborov]
arm64	2.18.0+dfsg-1+b1	3,456.7 kB	5,585.0 kB	[zoznam súborov]
hppa (neoficiálny port)	2.18.0+dfsg-1	3,506.9 kB	5,731.0 kB	[zoznam súborov]
ia64 (neoficiálny port)	2.18.0+dfsg-1+b1	3,636.0 kB	6,843.0 kB	[zoznam súborov]
m68k (neoficiálny port)	1.30.0-1	3,206.0 kB	5,170.0 kB	[zoznam súborov]
mips64el	2.18.0+dfsg-1+b1	3,452.0 kB	5,771.0 kB	[zoznam súborov]
ppc64 (neoficiálny port)	2.18.0+dfsg-1+b1	3,537.8 kB	6,173.0 kB	[zoznam súborov]
ppc64el	2.18.0+dfsg-1+b1	3,545.3 kB	5,969.0 kB	[zoznam súborov]
riscv64	2.18.0+dfsg-1+b2	3,518.6 kB	5,393.0 kB	[zoznam súborov]
s390x	2.18.0+dfsg-1+b1	3,509.8 kB	5,713.0 kB	[zoznam súborov]
sh4 (neoficiálny port)	2.18.0+dfsg-1	3,552.9 kB	5,453.0 kB	[zoznam súborov]
sparc64 (neoficiálny port)	1.34.1-1	3,424.1 kB	5,736.0 kB	[zoznam súborov]
x32 (neoficiálny port)	2.14.0-1	3,666.4 kB	5,700.0 kB	[zoznam súborov]