Balík: perm (0.4.0-8) [debports]
efficient mapping of short reads with periodic spaced seeds
PerM is a software package which was designed to perform highly efficient genome scale alignments for hundreds of millions of short reads produced by the ABI SOLiD and Illumina sequencing platforms. Today PerM is capable of providing full sensitivity for alignments within 4 mismatches for 50bp SOLID reads and 9 mismatches for 100bp Illumina reads.
Ostatné balíky súvisiace s balíkom perm
|
|
|
|
-
- dep: libbsd0 (>= 0.0)
- pomocné funkcie zo systémov BSD - zdieľaná knižnica
-
- dep: libc6 (>= 2.29)
- knižnica GNU C - zdieľané knižnice
tiež virtuálny balík poskytovaný balíkom libc6-udeb
-
- dep: libgcc-s2 (>= 4.2.1)
- podporná knižnica GCC
-
- dep: libgomp1 (>= 4.9)
- podporná knižnica GCC OpenMP (GOMP)
-
- dep: libstdc++6 (>= 5.2)
- štandardná knižnica C++ GNU v3
Stiahnuť perm
| Architektúra | Veľkosť balíka | Nainštalovaná veľkosť | Súbory |
|---|---|---|---|
| m68k (neoficiálny port) | 130.6 kB | 371.0 kB | [zoznam súborov] |