パッケージ: perm (0.4.0-8) [debports]
efficient mapping of short reads with periodic spaced seeds
PerM is a software package which was designed to perform highly efficient genome scale alignments for hundreds of millions of short reads produced by the ABI SOLiD and Illumina sequencing platforms. Today PerM is capable of providing full sensitivity for alignments within 4 mismatches for 50bp SOLID reads and 9 mismatches for 100bp Illumina reads.
その他の perm 関連パッケージ
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- dep: libbsd0 (>= 0.0)
- BSD システム由来のユーティリティ関数群 - 共有ライブラリ
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- dep: libc6 (>= 2.29)
- GNU C ライブラリ: 共有ライブラリ
以下のパッケージによって提供される仮想パッケージでもあります: libc6-udeb
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- dep: libgcc-s2 (>= 4.2.1)
- GCC 共有ライブラリ
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- dep: libgomp1 (>= 4.9)
- GCC OpenMP (GOMP) サポートライブラリ
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- dep: libstdc++6 (>= 5.2)
- GNU 標準 C++ ライブラリ v3