[ trixie ]
[ sid ]
[ Zdroj: bifrost ]
Balík: libbifrost0 (1.3.1-1)
Odkazy pre libbifrost0
Zdroje Debian:
Stiahnuť zdrojový balík bifrost:
Správcovia:
Externé zdroje:
- Domovská stránka [github.com]
Podobné balíky:
library for parallel construction, indexing and querying of de Bruijn graphs
Libbifrost is the shared library for the command-line tool bifrost for sequencing that features a broad range of functions, such as indexing, editing, and querying the graph, and includes a graph coloring method that maps each k-mer of the graph to the genomes it occurs in.
* Build, index, color and query the compacted de Bruijn graph * No need to build the uncompacted de Bruijn graph * Reads or assembled genomes as input * Output graph in GFA (can be visualized with Bandage), FASTA or binary * Graph cleaning: short tip clipping, etc. * Multi-threaded * No parameters to estimate with other tools * Exact or approximate k-mer search of queries
Ostatné balíky súvisiace s balíkom libbifrost0
|
|
|
|
-
- dep: libc6 (>= 2.34) [nie alpha, ia64]
- knižnica GNU C - zdieľané knižnice
tiež virtuálny balík poskytovaný balíkom libc6-udeb
-
- dep: libc6.1 (>= 2.34) [alpha]
- knižnica GNU C - zdieľané knižnice
tiež virtuálny balík poskytovaný balíkom libc6.1-udeb
- dep: libc6.1 (>= 2.37) [ia64]
-
- dep: libgcc-s1 (>= 3.0) [arm64, ppc64el, s390x]
- podporná knižnica GCC
- dep: libgcc-s1 (>= 3.4) [alpha, amd64, mips64el, ppc64, riscv64]
- dep: libgcc-s1 (>= 4.2) [ia64]
- dep: libgcc-s1 (>= 4.3) [sparc64]
-
- dep: libstdc++6 (>= 13.1)
- štandardná knižnica C++ GNU v3
-
- dep: libunwind8 [ia64]
- nnižnica na určenie na určenie postupnosti volania programu - dynamické súbory
-
- dep: zlib1g (>= 1:1.1.4)
- komprimačná knižnica - dynamická verzia
Stiahnuť libbifrost0
| Architektúra | Veľkosť balíka | Nainštalovaná veľkosť | Súbory |
|---|---|---|---|
| alpha (neoficiálny port) | 388.7 kB | 1,526.0 kB | [zoznam súborov] |
| amd64 | 417.9 kB | 1,436.0 kB | [zoznam súborov] |
| arm64 | 369.5 kB | 1,324.0 kB | [zoznam súborov] |
| ia64 (neoficiálny port) | 509.9 kB | 2,582.0 kB | [zoznam súborov] |
| mips64el | 350.8 kB | 1,504.0 kB | [zoznam súborov] |
| ppc64 (neoficiálny port) | 428.4 kB | 1,773.0 kB | [zoznam súborov] |
| ppc64el | 435.0 kB | 1,644.0 kB | [zoznam súborov] |
| riscv64 | 424.2 kB | 1,128.0 kB | [zoznam súborov] |
| s390x | 430.1 kB | 1,524.0 kB | [zoznam súborov] |
| sparc64 (neoficiálny port) | 354.0 kB | 2,125.0 kB | [zoznam súborov] |