Balík: cufflinks (2.2.1+dfsg.1-8 a iné) [non-free]

Odkazy pre cufflinks

Zdroje Debian:

Stiahnuť zdrojový balík cufflinks:

Správcovia:

Externé zdroje:

Domovská stránka [cufflinks.cbcb.umd.edu]

Podobné balíky:

Transcript assembly, differential expression and regulation for RNA-Seq

Cufflinks assembles transcripts, estimates their abundances, and tests for differential expression and regulation in RNA-Seq samples. It accepts aligned RNA-Seq reads and assembles the alignments into a parsimonious set of transcripts. Cufflinks then estimates the relative abundances of these transcripts based on how many reads support each one.

Značky: Biológia: Nucleic Acids, Pole: Biológia, field::biology:bioinformatics, implemented-in::c++, Role: Program, Works with: Biologické sekvencie

Ostatné balíky súvisiace s balíkom cufflinks

závisí

odporúča

navrhuje

vylepšuje

dep: libboost-serialization1.74.0 (>= 1.74.0)

knižnica na serializáciu pre C++
dep: libboost-thread1.74.0 (>= 1.74.0)

portabilný multi-threading pre C++
dep: libc6 (>= 2.29)

knižnica GNU C - zdieľané knižnice
tiež virtuálny balík poskytovaný balíkom libc6-udeb
dep: libgcc-s1 (>= 4.0) [amd64, armel, armhf]

podporná knižnica GCC

dep: libgcc-s1 (>= 4.1) [s390x]

dep: libgcc-s1 (>= 4.2) [i386, mipsel, ppc64el]

dep: libgcc-s1 (>= 4.5) [arm64, mips64el]
dep: libstdc++6 (>= 5.2)

štandardná knižnica C++ GNU v3
dep: python3

interactive high-level object-oriented language (default python3 version)
dep: zlib1g (>= 1:1.2.3.3)

komprimačná knižnica - dynamická verzia

rec: gffread

GFF/GTF format conversions, region filtering, FASTA sequence extraction

enh: tophat

Balík nie je dostupný

Stiahnuť cufflinks

Stiahnuť pre všetky dostupné architektúry
Architektúra	Verzia	Veľkosť balíka	Nainštalovaná veľkosť	Súbory
amd64	2.2.1+dfsg.1-8+b1	1,500.5 kB	10,384.0 kB	[zoznam súborov]
arm64	2.2.1+dfsg.1-8+b1	1,390.1 kB	9,869.0 kB	[zoznam súborov]
armel	2.2.1+dfsg.1-8+b1	1,211.9 kB	9,133.0 kB	[zoznam súborov]
armhf	2.2.1+dfsg.1-8+b1	1,114.3 kB	6,213.0 kB	[zoznam súborov]
i386	2.2.1+dfsg.1-8+b1	1,522.5 kB	10,603.0 kB	[zoznam súborov]
mips64el	2.2.1+dfsg.1-8+b1	1,561.7 kB	15,202.0 kB	[zoznam súborov]
mipsel	2.2.1+dfsg.1-8+b1	1,500.6 kB	13,369.0 kB	[zoznam súborov]
ppc64el	2.2.1+dfsg.1-8+b1	1,549.2 kB	13,797.0 kB	[zoznam súborov]
s390x	2.2.1+dfsg.1-8+b1	1,314.2 kB	10,901.0 kB	[zoznam súborov]