Balík: gmap (2021-02-22+ds-1)

Odkazy pre gmap

Zdroje Debian:

Stiahnuť zdrojový balík gmap:

Správcovia:

Externé zdroje:

Domovská stránka [research-pub.gene.com]

Podobné balíky:

spliced and SNP-tolerant alignment for mRNA and short reads

This package contains the programs GMAP and GSNAP as well as utilities to manage genome databases in GMAP/GSNAP format. GMAP (Genomic Mapping and Alignment Program) is a tool for aligning EST, mRNA and cDNA sequences. GSNAP (Genomic Short-read Nucleotide Alignment Program) is a tool for aligning single-end and paired-end transcriptome reads. Both tools can use a database of

 * known splice sites and identify novel splice sites.
 * known single-nucleotide polymorphisms (SNPs).

GSNAP can align bisulfite-treated DNA.

Značky: Pole: Biológia, field::biology:bioinformatics, field::biology:structural, Role: Program, Purpose: Analyzovanie

Ostatné balíky súvisiace s balíkom gmap

závisí

odporúča

navrhuje

vylepšuje

dep: libbz2-1.0

kvalitná knižnica na komprimáciu súborov s triedením blokov - dynamická knižnica
dep: libc6 (>= 2.29)

knižnica GNU C - zdieľané knižnice
tiež virtuálny balík poskytovaný balíkom libc6-udeb
dep: perl

Practical Extraction and Report Language od Larryho Walla
dep: zlib1g (>= 1:1.2.6)

komprimačná knižnica - dynamická verzia

Stiahnuť gmap

Stiahnuť pre všetky dostupné architektúry
Architektúra	Veľkosť balíka	Nainštalovaná veľkosť	Súbory
armel	5,605.3 kB	43,621.0 kB	[zoznam súborov]