všetky možnosti
bullseye  ] [  bookworm  ] [  trixie  ] [  sid  ]
[ Zdroj: yanosim  ]

Balík: yanosim (0.1-5)

Odkazy pre yanosim

Screenshot

Zdroje Debian:

Stiahnuť zdrojový balík yanosim:

Správcovia:

Externé zdroje:

Podobné balíky:

read simulator nanopore DRS datasets

Yanosim has three options:

1. yanosim model:

   Creates an model of mismatches, insertions and deletions
   based on an alignment of nanopore DRS reads to a
   reference. Reads should be aligned to a transcriptome
   i.e. without spliced alignment, using minimap2. They
   should have the cs tag.
2. yanosim quantify:
   Quantify the number of reads mapping to each
   transcript in a reference, so that the right number
   of reads can be simulated.
3. yanosim simulate:
   Given a model created using yanosim model, and
   per-transcript read counts created using yanosim
   simulate, simulate error-prone long-reads from the
   given fasta file.

Ostatné balíky súvisiace s balíkom yanosim

  • závisí
  • odporúča
  • navrhuje
  • vylepšuje

Stiahnuť yanosim

Stiahnuť pre všetky dostupné architektúry
Architektúra Veľkosť balíka Nainštalovaná veľkosť Súbory
amd64 9.4 kB45.0 kB [zoznam súborov]
arm64 9.4 kB45.0 kB [zoznam súborov]
armel 9.4 kB45.0 kB [zoznam súborov]
armhf 9.4 kB45.0 kB [zoznam súborov]
i386 9.4 kB45.0 kB [zoznam súborov]
mips64el 9.4 kB45.0 kB [zoznam súborov]
mipsel 9.4 kB45.0 kB [zoznam súborov]
ppc64el 9.4 kB45.0 kB [zoznam súborov]