Пакет исходного кода: sga (0.10.15-4)
Ссылки для sga
Ресурсы Debian:
Сопровождающие:
Внешние ресурсы:
Из этого пакета исходного кода собираются следующие двоичные пакеты:
- sga
- de novo genome assembler that uses string graphs
Другие пакеты, относящиеся к sga
-
- adep:
debhelper
(>= 11~)
- вспомогательные программы для debian/rules
-
- adep:
libsparsehash-dev
- Google's extremely memory-efficient C++ hash_map implementation
-
- adep:
zlib1g-dev
- библиотека сжатия (файлы для разработчиков)
- или
libz-dev
- виртуальный пакет, предоставляемый
zlib1g-dev
-
- adep:
libbamtools-dev
- C++ API for manipulating BAM (genome alignment) files
-
- adep:
gawk
- язык шаблонного сканирования и обработки GNU awk
-
- adep:
help2man
- автоматический генератор man-страниц
-
- adep:
samtools
- processing sequence alignments in SAM, BAM and CRAM formats
-
- adep:
python
- интерактивный объектно-ориентированный язык высокого уровня (ветка 2.x)
-
- adep:
python-ruffus
- Python computation pipeline library widely used in bioinformatics
-
- adep:
python-pysam
- interface for the SAM/BAM sequence alignment and mapping format (Python 2)
