[ bookworm ]
[ sid ]
[ Источник: python-cooler ]
Пакет: python3-cooler (0.9.3-1 и другие)
Ссылки для python3-cooler
Ресурсы Debian:
- Сообщения об ошибках
- Developer Information
- Debian журнал изменений
- Файл авторских прав
- Отслеживание заплат Debian
Исходный код python-cooler:
Сопровождающие:
Внешние ресурсы:
- Сайт [github.com]
Подобные пакеты:
library for a sparse, compressed, binary persistent storage
Cooler is a support library for a sparse, compressed, binary persistent storage format, also called cooler, used to store genomic interaction data, such as Hi-C contact matrices.
The cooler file format is an implementation of a genomic matrix data model using HDF5 as the container format. The cooler package includes a suite of command line tools and a Python API to facilitate creating, querying and manipulating cooler files.
Другие пакеты, относящиеся к python3-cooler
|
|
|
|
-
- dep: python3
- интерактивный высокоуровневый объектно-ориентированный язык (версия python3 по умолчанию)
-
- dep: python3-asciitree
- Draw tree structures using (ASCII or Unicode) characters
-
- dep: python3-biopython
- Python3 library for bioinformatics
-
- dep: python3-click
- Wrapper around optparse for command line utilities - Python 3.x
-
- dep: python3-cytoolz
- Toolz in Cython: High performance functional utilities
-
- dep: python3-h5py (>= 2.5)
- general-purpose Python interface to hdf5
-
- dep: python3-multiprocess
- better multiprocessing and multithreading in Python
-
- dep: python3-numpy
- Fast array facility to the Python language (Python 3)
-
- dep: python3-pairix
- 1D/2D indexing and querying with a pair of genomic coordinates
-
- dep: python3-pandas [alpha, ppc64]
- data structures for "relational" or "labeled" data
- dep: python3-pandas (>= 2.1) [не alpha, ppc64]
-
- dep: python3-pyfaidx
- efficient random access to fasta subsequences for Python 3
-
- dep: python3-pysam
- interface for the SAM/BAM sequence alignment and mapping format (Python 3)
-
- dep: python3-scipy (>= 1.10~)
- scientific tools for Python 3
-
- dep: python3-simplejson
- simple, fast, extensible JSON encoder/decoder for Python 3.x
-
- dep: python3-six [alpha, ppc64]
- Python 2 and 3 compatibility library
-
- dep: python3-yaml
- YAML parser and emitter for Python3
-
- rec: python3-dask
- Minimal task scheduling abstraction for Python 3
-
- sug: python3-pip
- Python package installer
Загрузка python3-cooler
| Архитектура | Версия | Размер пакета | В установленном виде | Файлы |
|---|---|---|---|---|
| alpha (неофициальный перенос) | 0.9.1-1 | 83,7 Кб | 383,0 Кб | [список файлов] |
| amd64 | 0.9.3-1 | 82,2 Кб | 381,0 Кб | [список файлов] |
| arm64 | 0.9.3-1 | 82,2 Кб | 381,0 Кб | [список файлов] |
| mips64el | 0.9.3-1 | 82,2 Кб | 381,0 Кб | [список файлов] |
| ppc64 (неофициальный перенос) | 0.9.1-1 | 83,7 Кб | 383,0 Кб | [список файлов] |
| ppc64el | 0.9.3-1 | 82,2 Кб | 381,0 Кб | [список файлов] |
| riscv64 | 0.9.3-1 | 82,2 Кб | 381,0 Кб | [список файлов] |