[ Источник: ragout ]
Пакет: ragout (2.3-5)
Ссылки для ragout
Ресурсы Debian:
- Сообщения об ошибках
- Developer Information
- Debian журнал изменений
- Файл авторских прав
- Отслеживание заплат Debian
Исходный код ragout:
Сопровождающие:
Внешние ресурсы:
- Сайт [github.com]
Подобные пакеты:
Reference-Assisted Genome Ordering UTility
Ragout (Reference-Assisted Genome Ordering UTility) is a tool for chromosome-level scaffolding using multiple references. Given initial assembly fragments (contigs/scaffolds) and one or multiple related references (complete or draft), it produces a chromosome-scale assembly (as a set of scaffolds).
The approach is based on the analysis of genome rearrangements (like inversions or chromosomal translocations) between the input genomes and reconstructing the most parsimonious structure of the target genome.
Ragout now supports both small and large genomes (of mammalian scale and complexity). The assembly of highly polymorphic genomes is currently limited.
Другие пакеты, относящиеся к ragout
|
|
|
|
-
- dep: libc6 (>= 2.34)
- библиотека GNU C: динамически подключаемые библиотеки
также виртуальный пакет, предоставляемый libc6-udeb
-
- dep: libgcc-s1 (>= 3.0)
- вспомогательная библиотека GCC
-
- dep: libstdc++6 (>= 13.1)
- стандартная библиотека GNU C++ версии 3
-
- dep: python3
- интерактивный высокоуровневый объектно-ориентированный язык (версия python3 по умолчанию)
-
- dep: python3-networkx
- tool to create, manipulate and study complex networks (Python3)
-
- dep: python3-six
- Python 2 and 3 compatibility library
-
- rec: sibelia
- comparative genomics tool
Загрузка ragout
| Архитектура | Размер пакета | В установленном виде | Файлы |
|---|---|---|---|
| ppc64el | 2 077,4 Кб | 9 791,0 Кб | [список файлов] |