все параметры
[  buster  ] [  bullseye  ] [  bullseye-backports  ] [  bookworm  ] [  trixie  ] [  sid  ]
[ Источник: ncbi-blast+  ]

Пакет: ncbi-blast+ (2.16.0+ds-6 и другие)

Ссылки для ncbi-blast+

Screenshot

Ресурсы Debian:

Исходный код ncbi-blast+:

Сопровождающие:

Внешние ресурсы:

Подобные пакеты:

поиск первичных биологических последовательностей

Популярная программа для поиска гомологичных последовательностей. Есть варианты BLAST (Basic Local Alignment Search Tool), которые сравнивают нуклеотидные последовательности с базой данных секвенированных нуклеиновых кислот и их участков, есть, которые сравнивают аминокислотные последовательности белка с имеющейся базой данных белков и их участков, а также есть варианты способные транслировать нуклеотидные последовательности в аминокислотные и потом выполнять поиск по соответствующим базам. PSI-BLAST создаёт PSSM (Position Specific Scoring Matrix) при поиске белковых гомологов и использует её для дальнейших поисков. Можно также выполнять поиск белков и нуклеотидов по базе данных PSSM. NCBI поддерживает веб-страницу BLAST по адресу blast.ncbi.nlm.nih.gov, а также сетевой сервис поиска известных последовательностей.

Теги: Область: Биология, Биоинформатика, Реализовано на: implemented-in::c++, interface::commandline, Роль: Программа, Цель: use::analysing, works-with::biological-sequence

Другие пакеты, относящиеся к ncbi-blast+

  • зависимости
  • рекомендации
  • предложения
  • enhances

Загрузка ncbi-blast+

Загрузить для всех доступных архитектур
Архитектура Версия Размер пакета В установленном виде Файлы
alpha (неофициальный перенос) 2.12.0+ds-4+b1 11 414,4 Кб59 755,0 Кб [список файлов]
amd64 2.16.0+ds-6+b1 14 885,0 Кб66 761,0 Кб [список файлов]
arm64 2.16.0+ds-6 13 513,5 Кб69 253,0 Кб [список файлов]
armel 2.16.0+ds-6+b1 12 804,2 Кб57 042,0 Кб [список файлов]
armhf 2.16.0+ds-6+b1 13 063,5 Кб46 863,0 Кб [список файлов]
hppa (неофициальный перенос) 2.16.0+ds-6+b1 14 763,6 Кб70 272,0 Кб [список файлов]
i386 2.16.0+ds-6+b1 16 211,9 Кб68 311,0 Кб [список файлов]
ia64 (неофициальный перенос) 2.12.0+ds-4+b1 13 417,0 Кб85 192,0 Кб [список файлов]
m68k (неофициальный перенос) 2.16.0+ds-6+b1 14 155,7 Кб61 829,0 Кб [список файлов]
mips64el 2.16.0+ds-6+b1 11 177,5 Кб86 558,0 Кб [список файлов]
ppc64 (неофициальный перенос) 2.16.0+ds-6+b1 14 677,8 Кб86 214,0 Кб [список файлов]
ppc64el 2.16.0+ds-6+b1 14 624,6 Кб79 174,0 Кб [список файлов]
riscv64 2.16.0+ds-6+b1 14 360,2 Кб56 113,0 Кб [список файлов]
s390x 2.16.0+ds-6+b1 14 165,3 Кб66 145,0 Кб [список файлов]
sh4 (неофициальный перенос) 2.16.0+ds-6+b1 25 738,4 Кб176 611,0 Кб [список файлов]
sparc64 (неофициальный перенос) 2.16.0+ds-6+b1 12 238,6 Кб149 916,0 Кб [список файлов]
x32 (неофициальный перенос) 2.16.0+ds-6+b1 14 955,6 Кб60 947,0 Кб [список файлов]