[ Источник: bio-vcf ]
Пакет: bio-vcf (0.9.5-3)
Ссылки для bio-vcf
Ресурсы Debian:
- Сообщения об ошибках
- Developer Information
- Debian журнал изменений
- Файл авторских прав
- Отслеживание заплат Debian
Исходный код bio-vcf:
Сопровождающие:
- Debian Med Packaging Team (Страница КК, Почтовый архив)
- Andreas Tille (Страница КК)
- Nilesh Patra (Страница КК)
Внешние ресурсы:
- Сайт [github.com]
Подобные пакеты:
domain specific language (DSL) for processing the VCF format
Bio-vcf provides a domain specific language (DSL) for processing the VCF format. Record named fields can be queried with regular expressions, e.g.
sample.dp>20 and rec.filter !~ /LowQD/ and rec.tumor.bcount[rec.alt]>4
Bio-vcf is a new generation VCF parser, filter and converter. Bio-vcf is not only very fast for genome-wide (WGS) data, it also comes with a really nice filtering, evaluation and rewrite language and it can output any type of textual data, including VCF header and contents in RDF and JSON.
Другие пакеты, относящиеся к bio-vcf
|
|
|
|
-
- dep: ruby
- интерпретатор объектно-ориентированного языка сценариев Ruby (основная версия)
Загрузка bio-vcf
| Архитектура | Размер пакета | В установленном виде | Файлы |
|---|---|---|---|
| all | 28,1 Кб | 141,0 Кб | [список файлов] |