Пакет: tabix (1.21+ds-0+exp2)

Ссылки для tabix

Ресурсы Debian:

Исходный код htslib:

Сопровождающие:

Внешние ресурсы:

Сайт [github.com]

Подобные пакеты:

Экспериментальный пакет

Предупреждение: данный пакет находится в экспериментальной ветке дистрибутива. Это означает, что он нестабилен или содержит ошибки, и даже может вызвать потерю данных. Перед использованием внимательно прочитайте файл changelog и другую доступную документацию.

generic indexer for TAB-delimited genome position files

Tabix indexes files where some columns indicate sequence coordinates: name (usually a chromosome), start and stop. The input data file must be position sorted and compressed by bgzip (provided in this package), which has a gzip like interface. After indexing, tabix is able to quickly retrieve data lines by chromosomal coordinates. Fast data retrieval also works over network if an URI is given as a file name.

This package is built from the HTSlib source, and provides the bgzip, htsfile, and tabix tools.

Теги: Реализовано на: C, Роль: Программа, Наука: science::calculation, use::calculating, Поддерживаемые форматы: HTML, язык гипертекстовой разметки, Работает с: Текст

Другие пакеты, относящиеся к tabix

зависимости

рекомендации

предложения

enhances

dep: libbz2-1.0

библиотека сжатия по алгоритму Барроуза—Уилера (динамическая версия)
dep: libc6 (>= 2.34) [не alpha, sh4]

библиотека GNU C: динамически подключаемые библиотеки
также виртуальный пакет, предоставляемый libc6-udeb

dep: libc6 (>= 2.40) [sh4]
dep: libc6.1 (>= 2.34) [alpha]

библиотека GNU C: динамически подключаемые библиотеки
также виртуальный пакет, предоставляемый libc6.1-udeb
dep: libdeflate0 (>= 1.0)

быстрое сжатие и распаковка блоков данных на основе DEFLATE
dep: libhtscodecs2 (>= 1.3.0)

Custom compression for CRAM and others
dep: liblzma5 (>= 5.1.1alpha+20120614)

библиотека для работы с архивами в формате XZ
dep: zlib1g (>= 1:1.1.4)

библиотека сжатия

Загрузка tabix

Загрузить для всех доступных архитектур
Архитектура	Размер пакета	В установленном виде	Файлы
alpha (неофициальный перенос)	487,7 Кб	2 703,0 Кб	[список файлов]
amd64	483,6 Кб	2 328,0 Кб	[список файлов]
arm64	449,0 Кб	2 316,0 Кб	[список файлов]
armel	411,2 Кб	2 089,0 Кб	[список файлов]
armhf	414,3 Кб	1 517,0 Кб	[список файлов]
hppa (неофициальный перенос)	466,6 Кб	2 305,0 Кб	[список файлов]
i386	528,3 Кб	2 629,0 Кб	[список файлов]
m68k (неофициальный перенос)	432,5 Кб	2 081,0 Кб	[список файлов]
mips64el	440,5 Кб	2 685,0 Кб	[список файлов]
ppc64 (неофициальный перенос)	499,5 Кб	3 148,0 Кб	[список файлов]
ppc64el	517,1 Кб	3 084,0 Кб	[список файлов]
riscv64	497,4 Кб	1 920,0 Кб	[список файлов]
s390x	472,1 Кб	2 504,0 Кб	[список файлов]
sh4 (неофициальный перенос)	500,4 Кб	2 060,0 Кб	[список файлов]
sparc64 (неофициальный перенос)	406,8 Кб	3 163,0 Кб	[список файлов]
x32 (неофициальный перенос)	485,2 Кб	2 281,0 Кб	[список файлов]