Пакет: tabix (1.20+ds-1)

Ссылки для tabix

Ресурсы Debian:

Исходный код htslib:

Сопровождающие:

Внешние ресурсы:

Сайт [github.com]

Подобные пакеты:

generic indexer for TAB-delimited genome position files

Tabix indexes files where some columns indicate sequence coordinates: name (usually a chromosome), start and stop. The input data file must be position sorted and compressed by bgzip (provided in this package), which has a gzip like interface. After indexing, tabix is able to quickly retrieve data lines by chromosomal coordinates. Fast data retrieval also works over network if an URI is given as a file name.

This package is built from the HTSlib source, and provides the bgzip, htsfile, and tabix tools.

Теги: Реализовано на: C, Роль: Программа, Наука: science::calculation, use::calculating, Поддерживаемые форматы: HTML, язык гипертекстовой разметки, Работает с: Текст

Другие пакеты, относящиеся к tabix

зависимости

рекомендации

предложения

enhances

dep: libbz2-1.0

библиотека сжатия по алгоритму Барроуза—Уилера (динамическая версия)
dep: libc6 (>= 2.34)

библиотека GNU C: динамически подключаемые библиотеки
также виртуальный пакет, предоставляемый libc6-udeb
dep: libdeflate0 (>= 1.0)

fast, whole-buffer DEFLATE-based compression and decompression
dep: libhtscodecs2 (>= 1.3.0)

Custom compression for CRAM and others
dep: liblzma5 (>= 5.1.1alpha+20120614)

библиотека для работы с архивами в формате XZ
dep: zlib1g (>= 1:1.1.4)

библиотека сжатия

Загрузка tabix

Загрузить для всех доступных архитектур
Архитектура	Размер пакета	В установленном виде	Файлы
amd64	471,4 Кб	2 249,0 Кб	[список файлов]
arm64	438,8 Кб	2 249,0 Кб	[список файлов]
armel	401,4 Кб	2 062,0 Кб	[список файлов]
armhf	404,8 Кб	1 494,0 Кб	[список файлов]
i386	517,3 Кб	2 566,0 Кб	[список файлов]
mips64el	430,6 Кб	2 618,0 Кб	[список файлов]
ppc64el	508,1 Кб	3 017,0 Кб	[список файлов]
riscv64	488,8 Кб	1 893,0 Кб	[список файлов]
s390x	462,5 Кб	2 465,0 Кб	[список файлов]