Пакет: maq (0.7.1-8)

Ссылки для maq

Ресурсы Debian:

Исходный код maq:

Сопровождающие:

Внешние ресурсы:

Сайт [maq.sourceforge.net]

Подобные пакеты:

maps short fixed-length polymorphic DNA sequence reads to reference sequences

Maq (short for Mapping and Assembly with Quality) builds mapping assemblies from short reads generated by the next-generation sequencing machines. It was particularly designed for Illumina-Solexa 1G Genetic Analyzer, and has a preliminary functionality to handle ABI SOLiD data. Maq is previously known as mapass2.

Developmemt of Maq stopped in 2008. Its successors are BWA and SAMtools.

Теги: Область: Биология, Биоинформатика, Реализовано на: implemented-in::c++, implemented-in::perl, Пользовательский интерфейс: Командная строка, Роль: role::program, scope::utility, Цель: Требуется дополнительный тег, Анализ, use::comparing, use::searching, Поддерживаемые форматы: Требуется дополнительный тег, works-with-format::plaintext, works-with::TODO

Другие пакеты, относящиеся к maq

зависимости

рекомендации

предложения

enhances

dep: libc6 (>= 2.27)

библиотека GNU C: динамически подключаемые библиотеки
также виртуальный пакет, предоставляемый libc6-udeb
dep: libgcc1 (>= 1:3.0) [amd64]

вспомогательная библиотека GCC

dep: libgcc1 (>= 1:3.5) [armhf]

dep: libgcc1 (>= 1:4.2) [arm64, i386]
dep: libstdc++6 (>= 5)

стандартная библиотека GNU C++ версии 3
dep: zlib1g (>= 1:1.2.3.3)

библиотека сжатия

sug: bwa

Burrows-Wheeler Aligner
sug: samtools

processing sequence alignments in SAM, BAM and CRAM formats

Загрузка maq

Загрузить для всех доступных архитектур
Архитектура	Размер пакета	В установленном виде	Файлы
amd64	305,4 Кб	553,0 Кб	[список файлов]
arm64	293,7 Кб	521,0 Кб	[список файлов]
armhf	302,6 Кб	492,0 Кб	[список файлов]
i386	319,8 Кб	609,0 Кб	[список файлов]