Пакет: python-pbalign (0.3.2-1)

Ссылки для python-pbalign

Ресурсы Debian:

Исходный код pbalign:

Сопровождающие:

Внешние ресурсы:

Сайт [github.com]

Подобные пакеты:

map Pacific Biosciences reads to reference DNA sequences (Python2)

pbalign aligns PacBio reads to reference sequences, filters aligned reads according to user-specific filtering criteria, and converts the output to either the SAM format or PacBio Compare HDF5 (e.g., .cmp.h5) format.

pbalign is part of the SMRTAnalysis suite. This package provides the Python library backend.

Другие пакеты, относящиеся к python-pbalign

зависимости

рекомендации

предложения

enhances

dep: blasr (>= 5.3+0)

mapping single-molecule sequencing reads
dep: python

интерактивный объектно-ориентированный язык высокого уровня (ветка 2.x)
dep: python-pbcommand

common command-line interface for Pacific Biosciences analysis modules
dep: python-pbcore

Python 2 library for processing PacBio data files
dep: python-pysam

interface for the SAM/BAM sequence alignment and mapping format (Python 2)

rec: hdf5-tools

Hierarchical Data Format 5 (HDF5) - Runtime tools
rec: python-pbh5tools

tools for manipulating Pacific Biosciences HDF5 files -- Python 2 library

sug: bowtie2

ultrafast memory-efficient short read aligner
sug: gmap

spliced and SNP-tolerant alignment for mRNA and short reads
sug: pbalign-doc

documentation for pbalign

Загрузка python-pbalign

Загрузить для всех доступных архитектур
Архитектура	Размер пакета	В установленном виде	Файлы
all	36,5 Кб	224,0 Кб	[список файлов]