Пакет: clustalw (2.1+lgpl-6)

Ссылки для clustalw

Ресурсы Debian:

Исходный код clustalw:

Сопровождающие:

Внешние ресурсы:

Сайт [www.clustal.org]

Подобные пакеты:

global multiple nucleotide or peptide sequence alignment

This program performs an alignment of multiple nucleotide or amino acid sequences. It recognizes the format of input sequences and whether the sequences are nucleic acid (DNA/RNA) or amino acid (proteins). The output format may be selected from in various formats for multiple alignments such as Phylip or FASTA. Clustal W is very well accepted.

The output of Clustal W can be edited manually but preferably with an alignment editor like SeaView or within its companion Clustal X. When building a model from your alignment, this can be applied for improved database searches. The Debian package hmmer creates such in form of an HMM.

Теги: Биология: Clustal/ALN, Протеины, Область: field::biology, field::biology:bioinformatics, Реализовано на: implemented-in::c++, interface::commandline, Пользовательский интерфейс: Интерактивный, на основе вводимого текста, Роль: role::program, scope::utility, Цель: Сравнение, Поддерживаемые форматы: works-with-format::plaintext, works-with::TODO

Другие пакеты, относящиеся к clustalw

зависимости

рекомендации

предложения

enhances

dep: libc6 (>= 2.14)

библиотека GNU C: динамически подключаемые библиотеки
также виртуальный пакет, предоставляемый libc6-udeb
dep: libgcc1 (>= 1:3.0)

вспомогательная библиотека GCC
dep: libstdc++6 (>= 5.2)

стандартная библиотека GNU C++ версии 3

sug: clustalx

Multiple alignment of nucleic acid and protein sequences (graphical interface)
sug: seaview

Multiplatform interface for sequence alignment and phylogeny

enh: bioperl-run

BioPerl wrappers: scripts
enh: emboss

European molecular biology open software suite
enh: t-coffee

Multiple Sequence Alignment

Загрузка clustalw

Загрузить для всех доступных архитектур
Архитектура	Размер пакета	В установленном виде	Файлы
amd64	275,2 Кб	775,0 Кб	[список файлов]