все параметры
[  buster  ] [  bullseye  ] [  bookworm  ] [  trixie  ] [  sid  ]
[ Источник: pscan-tfbs  ]

Пакет: pscan-tfbs (1.2.2-4)

Ссылки для pscan-tfbs

Screenshot

Ресурсы Debian:

Исходный код pscan-tfbs:

Сопровождающие:

Внешние ресурсы:

Подобные пакеты:

search for transcription factor binding sites

Pscan finds Over-represented Transcription Factor Binding Site Motifs in Sequences from Co-Regulated or Co-Expressed Genes.

Pscan is a software tool that scans a set of sequences (e.g. promoters) from co-regulated or co-expressed genes with motifs describing the binding specificity of known transcription factors and assesses which motifs are significantly over- or under-represented, providing thus hints on which transcription factors could be common regulators of the genes studied, together with the location of their candidate binding sites in the sequences. Pscan does not resort to comparisons with orthologous sequences and experimental results show that it compares favorably to other tools for the same task in terms of false positive predictions and computation time. The website is free and open to all users and there is no login requirement.

Другие пакеты, относящиеся к pscan-tfbs

  • зависимости
  • рекомендации
  • предложения
  • enhances

Загрузка pscan-tfbs

Загрузить для всех доступных архитектур
Архитектура Размер пакета В установленном виде Файлы
amd64 69,9 Кб188,0 Кб [список файлов]
arm64 62,9 Кб164,0 Кб [список файлов]
armel 60,0 Кб163,0 Кб [список файлов]
armhf 59,6 Кб123,0 Кб [список файлов]
i386 76,1 Кб203,0 Кб [список файлов]
mips64el 67,3 Кб197,0 Кб [список файлов]
mipsel 67,5 Кб196,0 Кб [список файлов]
ppc64el 71,3 Кб228,0 Кб [список файлов]
s390x 64,2 Кб188,0 Кб [список файлов]