Пакет: proteinortho (6.0.28+dfsg-1)

Ссылки для proteinortho

Ресурсы Debian:

Исходный код proteinortho:

Сопровождающие:

Внешние ресурсы:

Сайт [gitlab.com]

Подобные пакеты:

Detection of (Co-)orthologs in large-scale protein analysis

Proteinortho is a stand-alone tool that is geared towards large datasets and makes use of distributed computing techniques when run on multi-core hardware. It implements an extended version of the reciprocal best alignment heuristic. Proteinortho was applied to compute orthologous proteins in the complete set of all 717 eubacterial genomes available at NCBI at the beginning of 2009. Authors succeeded identifying thirty proteins present in 99% of all bacterial proteomes.

Другие пакеты, относящиеся к proteinortho

зависимости

рекомендации

предложения

enhances

dep: diamond-aligner

accelerated BLAST compatible local sequence aligner
dep: libc6 (>= 2.14) [amd64]

библиотека GNU C: динамически подключаемые библиотеки
также виртуальный пакет, предоставляемый libc6-udeb

dep: libc6 (>= 2.17) [arm64, ppc64el]

dep: libc6 (>= 2.7) [s390x]
dep: libgcc-s1 (>= 3.0)

вспомогательная библиотека GCC
dep: libgomp1 (>= 6)

вспомогательная библиотека GCC OpenMP (GOMP)
dep: liblapack3

библиотека подпрограмм линейной алгебры вер. 3 — динамическая версия
dep: libstdc++6 (>= 5.2)

стандартная библиотека GNU C++ версии 3
dep: ncbi-blast+

поиск первичных биологических последовательностей
dep: perl

практический язык Ларри Уолла для извлечения данных и составления отчётов
dep: procps

утилиты для файловой системы /proc
dep: python3

интерактивный высокоуровневый объектно-ориентированный язык (версия python3 по умолчанию)

Загрузка proteinortho

Загрузить для всех доступных архитектур
Архитектура	Размер пакета	В установленном виде	Файлы
amd64	206,0 Кб	790,0 Кб	[список файлов]
arm64	197,5 Кб	754,0 Кб	[список файлов]
ppc64el	209,6 Кб	946,0 Кб	[список файлов]
s390x	199,0 Кб	778,0 Кб	[список файлов]