Package: proteinortho (6.0.28+dfsg-1)

Links for proteinortho

Debian Resources:

Download Source Package proteinortho:

Maintainers:

Debian Med Packaging Team (QA Page, Mail Archive)
Andreas Tille (QA Page)
Nilesh Patra (QA Page)

External Resources:

Homepage [gitlab.com]

Similar packages:

Registrering af (Co-)ortologer i storskala proteinanalyse

Proteinortho er et uafhængigt værktøj, der er rettet mod store datasæt og gør brug af distribuerede beregningsteknikker, når afviklet på udstyr med flere kerner. Programmet implementerer en udvidet version af den reciprokke bedste sammenligningsheuristik. Proteinortho blev brugt til at beregne orthologous-proteiner i det fulde sæt med alle 717 eubakterielle genomer tilgængelige hos NCBI i begyndelsen af 2009. Forfattere lykkedes med at identificere 30 proteiner til stede i 99 % af alle bakterieproteomer.

Other Packages Related to proteinortho

depends

recommends

suggests

enhances

dep: diamond-aligner

Accelereret BLAST-kompatibel lokal sekvenssammenligner
dep: libc6 (>= 2.14) [amd64]

GNU C-bibliotek: Delte biblioteker
also a virtual package provided by libc6-udeb

dep: libc6 (>= 2.17) [arm64, ppc64el]

dep: libc6 (>= 2.7) [s390x]
dep: libgcc-s1 (>= 3.0)

GCC støttebibliotek
dep: libgomp1 (>= 6)

GCC OpenMP-understøttelsesbibliotek (GOMP)
dep: liblapack3

Bibliotek for lineære algebrarutiner 3 - delt version
dep: libstdc++6 (>= 5.2)

GNU Standard C++ bibliotek v3
dep: ncbi-blast+

Næste generation programpakke for BLAST-sekvens søgeværktøjer
dep: perl

Larry Walls praktiske uddragnings- og rapportsprog (Perl)
dep: procps

/proc-filsystemværktøjer
dep: python3

Interaktivt objektorienteret højniveausprog - standardversion af Python 3

Download proteinortho

Download for all available architectures
Architecture	Package Size	Installed Size	Files
amd64	206.0 kB	790.0 kB	[list of files]
arm64	197.5 kB	754.0 kB	[list of files]
ppc64el	209.6 kB	946.0 kB	[list of files]
s390x	199.0 kB	778.0 kB	[list of files]