Пакет: blasr (5.3.3+dfsg-5)

Ссылки для blasr

Ресурсы Debian:

Исходный код blasr:

Сопровождающие:

Внешние ресурсы:

Сайт [github.com]

Подобные пакеты:

mapping single-molecule sequencing reads

Basic local alignment with successive refinement (BLASR) is a method for mapping single-molecule sequencing reads against a reference genome. Such reads are thousands of bases long, with divergence between them and the genome being dominated by insertion and deletion error.

Другие пакеты, относящиеся к blasr

зависимости

рекомендации

предложения

enhances

dep: libblasr5.3.4 (>= 5.3.4+dfsg)

tools for aligning PacBio reads to target sequences
dep: libc6 (>= 2.29)

библиотека GNU C: динамически подключаемые библиотеки
также виртуальный пакет, предоставляемый libc6-udeb
dep: libgcc-s1 (>= 3.0)

вспомогательная библиотека GCC
dep: libhdf5-cpp-103-1 (>= 1.10.5)

HDF5 - C++ runtime files - serial version
dep: libpbbam1.6.0 (>= 1.6.0+dfsg)

Pacific Biosciences binary alignment/map (BAM) library
dep: libpbcopper1.8.0 (>= 1.8.0+dfsg)

data structures, algorithms, and utilities for C++ applications
dep: libpbseq

library for analyzing PacBio sequencing data
dep: libstdc++6 (>= 9)

стандартная библиотека GNU C++ версии 3

Загрузка blasr

Загрузить для всех доступных архитектур
Архитектура	Размер пакета	В установленном виде	Файлы
amd64	217,2 Кб	653,0 Кб	[список файлов]
arm64	189,6 Кб	577,0 Кб	[список файлов]
mips64el	200,9 Кб	718,0 Кб	[список файлов]
ppc64el	218,1 Кб	737,0 Кб	[список файлов]