Paket: blasr (5.3.3+dfsg-5)

Länkar för blasr

Debianresurser:

Hämta källkodspaketet blasr:

Ansvariga:

Externa resurser:

Hemsida [github.com]

Liknande paket:

mapping single-molecule sequencing reads

Basic local alignment with successive refinement (BLASR) is a method for mapping single-molecule sequencing reads against a reference genome. Such reads are thousands of bases long, with divergence between them and the genome being dominated by insertion and deletion error.

Andra paket besläktade med blasr

beror

rekommenderar

föreslår

enhances

dep: libblasr5.3.4 (>= 5.3.4+dfsg)

tools for aligning PacBio reads to target sequences
dep: libc6 (>= 2.29)

GNU C-bibliotek: Delade bibliotek
också ett virtuellt paket som tillhandahålls av libc6-udeb
dep: libgcc-s1 (>= 3.0)

GCC stödbibliotek
dep: libhdf5-cpp-103-1 (>= 1.10.5)

HDF5 - C++ runtime files - serial version
dep: libpbbam1.6.0 (>= 1.6.0+dfsg)

Pacific Biosciences binary alignment/map (BAM) library
dep: libpbcopper1.8.0 (>= 1.8.0+dfsg)

data structures, algorithms, and utilities for C++ applications
dep: libpbseq

library for analyzing PacBio sequencing data
dep: libstdc++6 (>= 9)

GNU standardbibliotek v3 för C++

Hämta blasr

Hämtningar för alla tillgängliga arkitekturer
Arkitektur	Paketstorlek	Installerad storlek	Filer
amd64	217,2 kbyte	653,0 kbyte	[filförteckning]
arm64	189,6 kbyte	577,0 kbyte	[filförteckning]
mips64el	200,9 kbyte	718,0 kbyte	[filförteckning]
ppc64el	218,1 kbyte	737,0 kbyte	[filförteckning]