[ Источник: mindthegap ]
Пакет: mindthegap (2.2.2-2)
Ссылки для mindthegap
Ресурсы Debian:
- Сообщения об ошибках
- Developer Information
- Debian журнал изменений
- Файл авторских прав
- Отслеживание заплат Debian
Исходный код mindthegap:
Сопровождающие:
Внешние ресурсы:
- Сайт [github.com]
Подобные пакеты:
performs detection and assembly of DNA insertion variants in NGS read datasets
Designed to call insertions of any size, whether they are novel or duplicated, homozygous or heterozygous in the donor genome. It takes as input a set of reads and a reference genome. It outputs two sets of FASTA sequences: one is the set of breakpoints of detection insertion sites, the other is the set of assembled insertions for each breakpoint. MindTheGap can also be used as a genome assembly finishing tool. It can fill the gaps between a set of input contigs without any a priori on their relative order and orientation. It outputs the results in gfa file.
Другие пакеты, относящиеся к mindthegap
|
|
|
|
-
- dep: libc6 (>= 2.14) [amd64]
- библиотека GNU C: динамически подключаемые библиотеки
также виртуальный пакет, предоставляемый libc6-udeb
- dep: libc6 (>= 2.17) [arm64, ppc64el]
- dep: libc6 (>= 2.8) [i386, mips64el, s390x]
-
- dep: libgatbcore3 (>= 1.4.2+dfsg)
- dynamic library of the Genome Analysis Toolbox
-
- dep: libgcc-s1 (>= 3.0) [не i386]
- вспомогательная библиотека GCC
- dep: libgcc-s1 (>= 4.2) [i386]
-
- dep: libhdf5-103-1
- HDF5 C runtime files - serial version
-
- dep: libstdc++6 (>= 9)
- стандартная библиотека GNU C++ версии 3
Загрузка mindthegap
| Архитектура | Размер пакета | В установленном виде | Файлы |
|---|---|---|---|
| amd64 | 227,5 Кб | 1 004,0 Кб | [список файлов] |
| arm64 | 204,1 Кб | 944,0 Кб | [список файлов] |
| i386 | 246,1 Кб | 1 031,0 Кб | [список файлов] |
| mips64el | 190,4 Кб | 1 087,0 Кб | [список файлов] |
| ppc64el | 225,7 Кб | 1 112,0 Кб | [список файлов] |
| s390x | 207,3 Кб | 996,0 Кб | [список файлов] |