Пакет: libseqlib-dev (1.2.0+dfsg-4)
Ссылки для libseqlib-dev
Ресурсы Debian:
- Сообщения об ошибках
- Developer Information
- Debian журнал изменений
- Файл авторских прав
- Отслеживание заплат Debian
Исходный код libseqlib:
- [libseqlib_1.2.0+dfsg-4.dsc]
- [libseqlib_1.2.0+dfsg.orig.tar.xz]
- [libseqlib_1.2.0+dfsg-4.debian.tar.xz]
Сопровождающие:
Внешние ресурсы:
- Сайт [github.com]
Подобные пакеты:
C++ htslib/bwa-mem/fermi interface for interrogating sequence data (dev)
C++ API and command line tool that provides a rapid and user-friendly interface to BAM/SAM/CRAM files, global sequence alignment operations and sequence assembly. Four C libraries perform core operations in SeqLib: HTSlib for BAM access, BWA-MEM and BLAT for sequence alignment and Fermi for error correction and sequence assembly. Benchmarking indicates that SeqLib has lower CPU and memory requirements than leading C++ sequence analysis APIs. Minimal SeqLib code can extract, error-correct and assemble reads from a CRAM file and then align with BWA-MEM. SeqLib also provides additional capabilities, including chromosome-aware interval queries and read plotting. Command line tools are available for performing integrated error correction, micro-assemblies and alignment.
This package contains the header files and static library.
Другие пакеты, относящиеся к libseqlib-dev
|
|
|
|
-
- dep: libbwa-dev
- Burrows-Wheeler Aligner source files
-
- dep: libfml-dev
- development headers for libfml
-
- dep: libhts-dev
- development files for the HTSlib
-
- dep: libjsoncpp-dev
- library for reading and writing JSON for C++ (devel files)
-
- dep: libseqlib2 (= 1.2.0+dfsg-4)
- C++ htslib/bwa-mem/fermi interface for interrogating sequence data
-
- dep: libssw-dev
- Development headers and static libraries for libssw
также виртуальный пакет, предоставляемый libssw-dev
-
- dep: zlib1g-dev
- библиотека сжатия (файлы для разработчиков)
Загрузка libseqlib-dev
| Архитектура | Размер пакета | В установленном виде | Файлы |
|---|---|---|---|
| amd64 | 206,2 Кб | 1 203,0 Кб | [список файлов] |
| arm64 | 199,5 Кб | 1 193,0 Кб | [список файлов] |
| armel | 201,1 Кб | 1 115,0 Кб | [список файлов] |
| armhf | 204,4 Кб | 1 015,0 Кб | [список файлов] |
| i386 | 219,9 Кб | 1 034,0 Кб | [список файлов] |
| mips64el | 223,7 Кб | 1 438,0 Кб | [список файлов] |
| mipsel | 221,4 Кб | 1 115,0 Кб | [список файлов] |
| ppc64el | 219,6 Кб | 1 310,0 Кб | [список файлов] |
| s390x | 190,7 Кб | 1 211,0 Кб | [список файлов] |