Пакет: libseqlib-dev (1.2.0+dfsg-9)
Ссылки для libseqlib-dev
Ресурсы Debian:
- Сообщения об ошибках
- Developer Information
- Debian журнал изменений
- Файл авторских прав
- Отслеживание заплат Debian
Исходный код libseqlib:
- [libseqlib_1.2.0+dfsg-9.dsc]
- [libseqlib_1.2.0+dfsg.orig.tar.xz]
- [libseqlib_1.2.0+dfsg-9.debian.tar.xz]
Сопровождающие:
- Debian Med Packaging Team (Страница КК, Почтовый архив)
- Andreas Tille (Страница КК)
- Étienne Mollier (Страница КК)
Внешние ресурсы:
- Сайт [github.com]
Подобные пакеты:
C++ htslib/bwa-mem/fermi interface for interrogating sequence data (dev)
C++ API and command line tool that provides a rapid and user-friendly interface to BAM/SAM/CRAM files, global sequence alignment operations and sequence assembly. Four C libraries perform core operations in SeqLib: HTSlib for BAM access, BWA-MEM and BLAT for sequence alignment and Fermi for error correction and sequence assembly. Benchmarking indicates that SeqLib has lower CPU and memory requirements than leading C++ sequence analysis APIs. Minimal SeqLib code can extract, error-correct and assemble reads from a CRAM file and then align with BWA-MEM. SeqLib also provides additional capabilities, including chromosome-aware interval queries and read plotting. Command line tools are available for performing integrated error correction, micro-assemblies and alignment.
This package contains the header files and static library.
Другие пакеты, относящиеся к libseqlib-dev
|
|
|
|
-
- dep: libbwa-dev
- Burrows-Wheeler Aligner source files
-
- dep: libfml-dev
- development headers for libfml
-
- dep: libhts-dev
- development files for the HTSlib
-
- dep: libjsoncpp-dev
- library for reading and writing JSON for C++ (devel files)
-
- dep: libseqlib2 (= 1.2.0+dfsg-9)
- C++ htslib/bwa-mem/fermi interface for interrogating sequence data
-
- dep: libssw-dev
- Development headers and static libraries for libssw
также виртуальный пакет, предоставляемый libssw-dev
-
- dep: zlib1g-dev
- библиотека сжатия (файлы для разработчиков)
Загрузка libseqlib-dev
| Архитектура | Размер пакета | В установленном виде | Файлы |
|---|---|---|---|
| amd64 | 204,5 Кб | 1 166,0 Кб | [список файлов] |
| arm64 | 197,4 Кб | 1 162,0 Кб | [список файлов] |
| armel | 198,5 Кб | 1 082,0 Кб | [список файлов] |
| armhf | 201,1 Кб | 983,0 Кб | [список файлов] |
| i386 | 218,3 Кб | 1 011,0 Кб | [список файлов] |
| mips64el | 221,2 Кб | 1 408,0 Кб | [список файлов] |
| mipsel | 218,3 Кб | 1 089,0 Кб | [список файлов] |
| ppc64el | 220,0 Кб | 1 285,0 Кб | [список файлов] |
| s390x | 188,5 Кб | 1 170,0 Кб | [список файлов] |