[ Источник: hinge ]
Пакет: hinge (0.5.0-7 и другие)
Ссылки для hinge
Ресурсы Debian:
- Сообщения об ошибках
- Developer Information
- Debian журнал изменений
- Файл авторских прав
- Отслеживание заплат Debian
Исходный код hinge:
Сопровождающие:
Внешние ресурсы:
- Сайт [github.com]
Подобные пакеты:
long read genome assembler based on hinging
HINGE is a genome assembler that seeks to achieve optimal repeat resolution by distinguishing repeats that can be resolved given the data from those that cannot. This is accomplished by adding “hinges” to reads for constructing an overlap graph where only unresolvable repeats are merged. As a result, HINGE combines the error resilience of overlap-based assemblers with repeat-resolution capabilities of de Bruijn graph assemblers.
Другие пакеты, относящиеся к hinge
|
|
|
|
-
- dep: daligner
- выравнивание длинных нуклеотидных последовательностей
-
- dep: dascrubber
- alignment-based scrubbing pipeline for DNA sequencing reads
-
- dep: dazzdb
- manage nucleotide sequencing read data
-
- dep: libc6 (>= 2.34)
- библиотека GNU C: динамически подключаемые библиотеки
также виртуальный пакет, предоставляемый libc6-udeb
-
- dep: libfmt9 (>= 9.0.0+ds1)
- fast type-safe C++ formatting library -- library
-
- dep: libgcc-s1 (>= 3.0)
- вспомогательная библиотека GCC
-
- dep: libgomp1 (>= 4.2.1)
- вспомогательная библиотека GCC OpenMP (GOMP)
-
- dep: libstdc++6 (>= 11)
- стандартная библиотека GNU C++ версии 3
-
- dep: python3
- interactive high-level object-oriented language (default python3 version)
-
- dep: python3-colormap
- ease manipulation of matplotlib colormaps and color codecs (Python 3)
-
- dep: python3-matplotlib
- Python based plotting system in a style similar to Matlab (Python 3)
-
- dep: python3-networkx
- tool to create, manipulate and study complex networks (Python3)
-
- dep: python3-numpy
- Fast array facility to the Python 3 language
-
- dep: python3-pbcore
- Python 3 library for processing PacBio data files
-
- dep: python3-ujson
- ultra fast JSON encoder and decoder for Python 3
-
- dep: zlib1g (>= 1:1.1.4)
- библиотека сжатия
Загрузка hinge
| Архитектура | Версия | Размер пакета | В установленном виде | Файлы |
|---|---|---|---|---|
| ppc64el | 0.5.0-7+b1 | 475,4 Кб | 4 212,0 Кб | [список файлов] |