Pakiet: sumaclust (1.0.36+ds-2 i inne)

Odnośniki dla sumaclust

Zasoby systemu Debian:

Pobieranie pakietu źródłowego sumaclust:

Opiekunowie:

Debian Med Packaging Team (Strona QA, Archiwum e-mail)
Tim Booth (Strona QA)
Andreas Tille (Strona QA)
Pierre Gruet (Strona QA)

Zasoby zewnętrzne:

Strona internetowa [metabarcoding.org]

Podobne pakiety:

fast and exact clustering of genomic sequences

With the development of next-generation sequencing, efficient tools are needed to handle millions of sequences in reasonable amounts of time. Sumaclust is a program developed by the LECA. Sumaclust aims to cluster sequences in a way that is fast and exact at the same time. This tool has been developed to be adapted to the type of data generated by DNA metabarcoding, i.e. entirely sequenced, short markers. Sumaclust clusters sequences using the same clustering algorithm as UCLUST and CD- HIT. This algorithm is mainly useful to detect the 'erroneous' sequences created during amplification and sequencing protocols, deriving from 'true' sequences.

Inne pakiety związane z sumaclust

wymaga

poleca

sugeruje

enhances

dep: libc6 (>= 2.14) [amd64]

Biblioteka GNU C: biblioteki współdzielone
również pakiet wirtualny udostępniany przez libc6-udeb

dep: libc6 (>= 2.16) [x32]

dep: libc6 (>= 2.17) [arm64, ppc64el]

dep: libc6 (>= 2.33) [sh4]

dep: libc6 (>= 2.34) [riscv64]

dep: libc6 (>= 2.7) [nie alpha, amd64, arm64, ia64, ppc64el, riscv64, sh4, x32]
dep: libc6.1 (>= 2.33) [ia64]

Biblioteka GNU C: biblioteki współdzielone
również pakiet wirtualny udostępniany przez libc6.1-udeb

dep: libc6.1 (>= 2.7) [alpha]
dep: libgomp1 (>= 6)

Biblioteka wspierająca GCC OpenMP (GOMP)
dep: libsuma1 (>= 1.0.35)

shared library for sumatra and sumaclust

Pobieranie sumaclust

Pobierz dla wszystkich dostępnych architektur
Architektura	Wersja	Rozmiar pakietu	Rozmiar po instalacji	Pliki
alpha (port nieoficjalny)	1.0.36+ds-2	101,8 KiB	196,0 KiB	[lista plików]
amd64	1.0.36+ds-2	100,6 KiB	164,0 KiB	[lista plików]
arm64	1.0.36+ds-2	99,6 KiB	195,0 KiB	[lista plików]
armel	1.0.36+ds-2	101,6 KiB	195,0 KiB	[lista plików]
armhf	1.0.36+ds-2	99,5 KiB	195,0 KiB	[lista plików]
hppa (port nieoficjalny)	1.0.36+ds-2	100,9 KiB	160,0 KiB	[lista plików]
i386	1.0.36+ds-2	100,9 KiB	163,0 KiB	[lista plików]
ia64 (port nieoficjalny)	1.0.36+ds-2	104,5 KiB	181,0 KiB	[lista plików]
m68k (port nieoficjalny)	1.0.36+ds-2	98,8 KiB	163,0 KiB	[lista plików]
mips64el	1.0.36+ds-2	100,1 KiB	197,0 KiB	[lista plików]
ppc64 (port nieoficjalny)	1.0.36+ds-2	101,5 KiB	196,0 KiB	[lista plików]
ppc64el	1.0.36+ds-2	101,4 KiB	260,0 KiB	[lista plików]
riscv64	1.0.36+ds-2+b1	100,4 KiB	156,0 KiB	[lista plików]
s390x	1.0.36+ds-2	99,5 KiB	159,0 KiB	[lista plików]
sh4 (port nieoficjalny)	1.0.36+ds-2	100,3 KiB	195,0 KiB	[lista plików]
sparc64 (port nieoficjalny)	1.0.36+ds-2	99,5 KiB	1 157,0 KiB	[lista plików]
x32 (port nieoficjalny)	1.0.36+ds-2	100,6 KiB	163,0 KiB	[lista plików]