Пакет: sumaclust (1.0.36+ds-2 и другие)

Ссылки для sumaclust

Ресурсы Debian:

Исходный код sumaclust:

Сопровождающие:

Внешние ресурсы:

Сайт [metabarcoding.org]

Подобные пакеты:

fast and exact clustering of genomic sequences

With the development of next-generation sequencing, efficient tools are needed to handle millions of sequences in reasonable amounts of time. Sumaclust is a program developed by the LECA. Sumaclust aims to cluster sequences in a way that is fast and exact at the same time. This tool has been developed to be adapted to the type of data generated by DNA metabarcoding, i.e. entirely sequenced, short markers. Sumaclust clusters sequences using the same clustering algorithm as UCLUST and CD- HIT. This algorithm is mainly useful to detect the 'erroneous' sequences created during amplification and sequencing protocols, deriving from 'true' sequences.

Другие пакеты, относящиеся к sumaclust

зависимости

рекомендации

предложения

enhances

dep: libc6 (>= 2.14) [amd64]

библиотека GNU C: динамически подключаемые библиотеки
также виртуальный пакет, предоставляемый libc6-udeb

dep: libc6 (>= 2.16) [x32]

dep: libc6 (>= 2.17) [arm64, ppc64el]

dep: libc6 (>= 2.33) [sh4]

dep: libc6 (>= 2.34) [riscv64]

dep: libc6 (>= 2.7) [не alpha, amd64, arm64, ia64, ppc64el, riscv64, sh4, x32]
dep: libc6.1 (>= 2.33) [ia64]

библиотека GNU C: динамически подключаемые библиотеки
также виртуальный пакет, предоставляемый libc6.1-udeb

dep: libc6.1 (>= 2.7) [alpha]
dep: libgomp1 (>= 6)

вспомогательная библиотека GCC OpenMP (GOMP)
dep: libsuma1 (>= 1.0.35)

shared library for sumatra and sumaclust

Загрузка sumaclust

Загрузить для всех доступных архитектур
Архитектура	Версия	Размер пакета	В установленном виде	Файлы
alpha (неофициальный перенос)	1.0.36+ds-2	101,8 Кб	196,0 Кб	[список файлов]
amd64	1.0.36+ds-2	100,6 Кб	164,0 Кб	[список файлов]
arm64	1.0.36+ds-2	99,6 Кб	195,0 Кб	[список файлов]
armel	1.0.36+ds-2	101,6 Кб	195,0 Кб	[список файлов]
armhf	1.0.36+ds-2	99,5 Кб	195,0 Кб	[список файлов]
hppa (неофициальный перенос)	1.0.36+ds-2	100,9 Кб	160,0 Кб	[список файлов]
i386	1.0.36+ds-2	100,9 Кб	163,0 Кб	[список файлов]
ia64 (неофициальный перенос)	1.0.36+ds-2	104,5 Кб	181,0 Кб	[список файлов]
m68k (неофициальный перенос)	1.0.36+ds-2	98,8 Кб	163,0 Кб	[список файлов]
mips64el	1.0.36+ds-2	100,1 Кб	197,0 Кб	[список файлов]
ppc64 (неофициальный перенос)	1.0.36+ds-2	101,5 Кб	196,0 Кб	[список файлов]
ppc64el	1.0.36+ds-2	101,4 Кб	260,0 Кб	[список файлов]
riscv64	1.0.36+ds-2+b1	100,4 Кб	156,0 Кб	[список файлов]
s390x	1.0.36+ds-2	99,5 Кб	159,0 Кб	[список файлов]
sh4 (неофициальный перенос)	1.0.36+ds-2	100,3 Кб	195,0 Кб	[список файлов]
sparc64 (неофициальный перенос)	1.0.36+ds-2	99,5 Кб	1 157,0 Кб	[список файлов]
x32 (неофициальный перенос)	1.0.36+ds-2	100,6 Кб	163,0 Кб	[список файлов]