Pakiet: kissplice (2.6.2-3 i inne)

Odnośniki dla kissplice

Zasoby systemu Debian:

Pobieranie pakietu źródłowego kissplice:

Opiekunowie:

Zasoby zewnętrzne:

Strona internetowa [kissplice.prabi.fr]

Podobne pakiety:

Detection of various kinds of polymorphisms in RNA-seq data

KisSplice is a piece of software that enables the analysis of RNA-seq data with or without a reference genome. It is an exact local transcriptome assembler that allows one to identify SNPs, indels and alternative splicing events. It can deal with an arbitrary number of biological conditions, and will quantify each variant in each condition. It has been tested on Illumina datasets of up to 1G reads. Its memory consumption is around 5Gb for 100M reads.

Inne pakiety związane z kissplice

wymaga

poleca

sugeruje

enhances

dep: bcalm [nie alpha, hppa, m68k, sh4, x32]

de Bruijn compaction in low memory
dep: libc6 (>= 2.11) [hppa]

Biblioteka GNU C: biblioteki współdzielone
również pakiet wirtualny udostępniany przez libc6-udeb

dep: libc6 (>= 2.17) [sh4]

dep: libc6 (>= 2.29) [x32]

dep: libc6 (>= 2.34) [nie alpha, hppa, ia64, m68k, sh4, x32]

dep: libc6 (>= 2.4) [m68k]
dep: libc6.1 (>= 2.37) [ia64]

Biblioteka GNU C: biblioteki współdzielone
również pakiet wirtualny udostępniany przez libc6.1-udeb

dep: libc6.1 (>= 2.4) [alpha]
dep: libgcc-s1 (>= 3.0) [amd64, arm64, mips64el, ppc64, ppc64el, x32]

Biblioteka wspomagająca GCC

dep: libgcc-s1 (>= 3.4) [sparc64]

dep: libgcc-s1 (>= 4.2) [ia64]

dep: libgcc-s1 (>= 4.3) [riscv64]
dep: libgcc1 (>= 1:4.1.1) [alpha]

Pakiet niedostępny

dep: libgcc1 (>= 1:4.2.1) [sh4]
dep: libgcc2 (>= 4.2.1) [m68k]

Pakiet niedostępny
dep: libgcc4 (>= 4.1.1) [hppa]

Pakiet niedostępny
dep: libgomp1 (>= 4.9) [nie alpha, hppa, m68k, sh4, x32]

Biblioteka wspierająca GCC OpenMP (GOMP)
dep: libstdc++6 (>= 13.1) [nie alpha, hppa, m68k, sh4, x32]

Standardowa biblioteka GNU C++, wersja 3

dep: libstdc++6 (>= 4.6) [hppa, sh4]

dep: libstdc++6 (>= 4.9) [alpha, m68k]

dep: libstdc++6 (>= 9) [x32]
dep: libunwind8 [ia64]

Biblioteka do ustalania łańcucha wywołań programu - środowisko uruchomieniowe
dep: python [alpha, hppa, m68k, sh4]

Pakiet niedostępny
dep: python3 [nie alpha, hppa, m68k, sh4]

Interaktywny, wysokopoziomowy i obiektowy język programowania (domyślna wersja Python 3)
dep: zlib1g (>= 1:1.1.4) [nie alpha, hppa, m68k, sh4]

Biblioteka kompresyjna - pliki wykonawcze

dep: zlib1g (>= 1:1.2.3.4) [alpha, hppa, m68k, sh4]

Pobieranie kissplice

Pobierz dla wszystkich dostępnych architektur
Architektura	Wersja	Rozmiar pakietu	Rozmiar po instalacji	Pliki
alpha (port nieoficjalny)	2.2.1-1	596,7 KiB	1 376,0 KiB	[lista plików]
amd64	2.6.2-3	488,0 KiB	1 211,0 KiB	[lista plików]
arm64	2.6.2-3	474,5 KiB	1 371,0 KiB	[lista plików]
hppa (port nieoficjalny)	2.1.0-1	1 289,9 KiB	2 181,0 KiB	[lista plików]
ia64 (port nieoficjalny)	2.6.2-3	506,4 KiB	1 581,0 KiB	[lista plików]
m68k (port nieoficjalny)	2.2.1-1	555,8 KiB	1 120,0 KiB	[lista plików]
mips64el	2.6.2-3	481,0 KiB	1 467,0 KiB	[lista plików]
ppc64 (port nieoficjalny)	2.6.2-3	490,5 KiB	1 499,0 KiB	[lista plików]
ppc64el	2.6.2-3	491,5 KiB	1 435,0 KiB	[lista plików]
riscv64	2.6.2-3	484,2 KiB	1 059,0 KiB	[lista plików]
sh4 (port nieoficjalny)	2.1.0-1	1 282,1 KiB	2 090,0 KiB	[lista plików]
sparc64 (port nieoficjalny)	2.6.2-3	467,2 KiB	7 784,0 KiB	[lista plików]
x32 (port nieoficjalny)	2.5.3-1	4 035,5 KiB	15 302,0 KiB	[lista plików]