[ Source: kissplice ]
Package: kissplice (2.6.2-3 and others)
Links for kissplice
Debian Resources:
Download Source Package kissplice:
Maintainers:
- Debian Med Packaging Team (QA Page, Mail Archive)
- Andreas Tille (QA Page)
- Francois Gindraud (QA Page)
External Resources:
- Homepage [kissplice.prabi.fr]
Similar packages:
rilevamento di vari tipi di polimorfismi in dati RNA-Seq
KisSplice è un software che permette l'analisi di dati RNA-Seq con o senza un genoma di riferimento. È un assemblatore esatto di trascrittoma che permette di identificare SNP, indel e eventi di splicing alternativo. Può lavorare con un numero arbitrario di condizioni biologiche e quantifica ciascuna variante in ogni condizione. È stato provato su insiemi di dati Illumina con fino a 1G di letture. Il suo consumo di memoria è di circa 5Gb per 100M letture.
Other Packages Related to kissplice
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- dep: bcalm [not alpha, hppa, m68k, sh4, x32]
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- dep: libc6 (>= 2.11) [hppa]
- Libreria C GNU: librerie condivise
also a virtual package provided by libc6-udeb
- dep: libc6 (>= 2.17) [sh4]
- dep: libc6 (>= 2.29) [x32]
- dep: libc6 (>= 2.34) [not alpha, hppa, ia64, m68k, sh4, x32]
- dep: libc6 (>= 2.4) [m68k]
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- dep: libc6.1 (>= 2.37) [ia64]
- Libreria C GNU: librerie condivise
also a virtual package provided by libc6.1-udeb
- dep: libc6.1 (>= 2.4) [alpha]
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- dep: libgcc1 (>= 1:4.1.1) [alpha]
- Package not available
- dep: libgcc1 (>= 1:4.2.1) [sh4]
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- dep: libgcc2 (>= 4.2.1) [m68k]
- Package not available
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- Package not available
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- dep: libgomp1 (>= 4.9) [not alpha, hppa, m68k, sh4, x32]
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-
- dep: libstdc++6 (>= 13.1) [not alpha, hppa, m68k, sh4, x32]
- libreria GNU Standard C++, versione 3
- dep: libstdc++6 (>= 4.6) [hppa, sh4]
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- dep: libstdc++6 (>= 9) [x32]
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- dep: libunwind8 [ia64]
- libreria per tracciare la catena di chiamate di un programma - runtime
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- dep: python [alpha, hppa, m68k, sh4]
- Package not available
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- dep: python3 [not alpha, hppa, m68k, sh4]
- linguaggio interattivo di alto livello orientato agli oggetti (versione python3 predefinita)
-
- dep: zlib1g (>= 1:1.1.4) [not alpha, hppa, m68k, sh4]
- libreria di compressione - runtime
- dep: zlib1g (>= 1:1.2.3.4) [alpha, hppa, m68k, sh4]
Download kissplice
| Architecture | Version | Package Size | Installed Size | Files |
|---|---|---|---|---|
| alpha (unofficial port) | 2.2.1-1 | 596.7 kB | 1,376.0 kB | [list of files] |
| amd64 | 2.6.2-3 | 488.0 kB | 1,211.0 kB | [list of files] |
| arm64 | 2.6.2-3 | 474.5 kB | 1,371.0 kB | [list of files] |
| hppa (unofficial port) | 2.1.0-1 | 1,289.9 kB | 2,181.0 kB | [list of files] |
| ia64 (unofficial port) | 2.6.2-3 | 506.4 kB | 1,581.0 kB | [list of files] |
| m68k (unofficial port) | 2.2.1-1 | 555.8 kB | 1,120.0 kB | [list of files] |
| mips64el | 2.6.2-3 | 481.0 kB | 1,467.0 kB | [list of files] |
| ppc64 (unofficial port) | 2.6.2-3 | 490.5 kB | 1,499.0 kB | [list of files] |
| ppc64el | 2.6.2-3 | 491.5 kB | 1,435.0 kB | [list of files] |
| riscv64 | 2.6.2-3 | 484.2 kB | 1,059.0 kB | [list of files] |
| sh4 (unofficial port) | 2.1.0-1 | 1,282.1 kB | 2,090.0 kB | [list of files] |
| sparc64 (unofficial port) | 2.6.2-3 | 467.2 kB | 7,784.0 kB | [list of files] |
| x32 (unofficial port) | 2.5.3-1 | 4,035.5 kB | 15,302.0 kB | [list of files] |