Pakiet: anfo (0.98-9)

Odnośniki dla anfo

Zasoby systemu Debian:

Pobieranie pakietu źródłowego anfo:

Opiekunowie:

Zasoby zewnętrzne:

Strona internetowa [bioinf.eva.mpg.de]

Podobne pakiety:

Short Read Aligner/Mapper from MPG

Anfo is a mapper in the spirit of Soap/Maq/Bowtie, but its implementation takes more after BLAST/BLAT. It's most useful for the alignment of sequencing reads where the DNA sequence is somehow modified (think ancient DNA or bisulphite treatment) and/or there is more divergence between sample and reference than what fast mappers will handle gracefully (say the reference genome is missing and a related species is used instead).

Inne pakiety związane z anfo

wymaga

poleca

sugeruje

enhances

dep: libanfo0 (>= 0.98)

Library for Short Read Aligner/Mapper from MPG
dep: libbz2-1.0 [sparc64]

Wysokiej jakości biblioteka kompresji plików - wersja uruchomieniowa
dep: libc6 (>= 2.27) [riscv64]

Biblioteka GNU C: biblioteki współdzielone
również pakiet wirtualny udostępniany przez libc6-udeb

dep: libc6 (>= 2.29) [nie alpha, ia64, riscv64, sh4]

dep: libc6 (>= 2.32) [sh4]
dep: libc6.1 (>= 2.29) [alpha]

Biblioteka GNU C: biblioteki współdzielone
również pakiet wirtualny udostępniany przez libc6.1-udeb

dep: libc6.1 (>= 2.32) [ia64]
dep: libelk0

implementation of Scheme (the Extension Language Kit)
dep: libgcc-s1 (>= 3.0) [amd64, arm64, mips64el, ppc64, ppc64el, s390x, x32]

Biblioteka wspomagająca GCC

dep: libgcc-s1 (>= 3.4) [alpha, riscv64, sh4, sparc64]

dep: libgcc-s1 (>= 3.5) [armel, armhf]

dep: libgcc-s1 (>= 4.2) [i386, ia64]
dep: libgcc-s2 (>= 4.2.1) [m68k]

Biblioteka wspomagająca GCC
dep: libgcc-s4 (>= 4.1.1) [hppa]

Biblioteka wspomagająca GCC
dep: libpopt0 (>= 1.14)

Biblioteka parsera parametrów linii komend
dep: libprotobuf17 [ia64]

protocol buffers C++ library
dep: libprotobuf23 (>= 3.12.4) [nie ia64]

protocol buffers C++ library
dep: libstdc++6 (>= 9)

Standardowa biblioteka GNU C++, wersja 3
dep: libunwind8 [ia64]

Biblioteka do ustalania łańcucha wywołań programu - środowisko uruchomieniowe
dep: zlib1g (>= 1:1.1.4)

Biblioteka kompresyjna - pliki wykonawcze

Pobieranie anfo

Pobierz dla wszystkich dostępnych architektur
Architektura	Rozmiar pakietu	Rozmiar po instalacji	Pliki
alpha (port nieoficjalny)	113,7 KiB	446,0 KiB	[lista plików]
amd64	113,9 KiB	439,0 KiB	[lista plików]
arm64	105,0 KiB	395,0 KiB	[lista plików]
armel	100,0 KiB	345,0 KiB	[lista plików]
armhf	101,9 KiB	305,0 KiB	[lista plików]
hppa (port nieoficjalny)	115,0 KiB	387,0 KiB	[lista plików]
i386	119,5 KiB	413,0 KiB	[lista plików]
ia64 (port nieoficjalny)	135,6 KiB	620,0 KiB	[lista plików]
m68k (port nieoficjalny)	113,7 KiB	405,0 KiB	[lista plików]
mips64el	109,6 KiB	438,0 KiB	[lista plików]
ppc64 (port nieoficjalny)	115,0 KiB	619,0 KiB	[lista plików]
ppc64el	114,9 KiB	619,0 KiB	[lista plików]
riscv64 (port nieoficjalny)	109,9 KiB	361,0 KiB	[lista plików]
s390x	104,1 KiB	411,0 KiB	[lista plików]
sh4 (port nieoficjalny)	125,5 KiB	383,0 KiB	[lista plików]
sparc64 (port nieoficjalny)	100,0 KiB	418,0 KiB	[lista plików]
x32 (port nieoficjalny)	113,9 KiB	389,0 KiB	[lista plików]