[ Source: anfo ]
Пакунок: anfo (0.98-9)
Links for anfo
Debian Resources:
Download Source Package anfo:
Maintainers:
External Resources:
- Homepage [bioinf.eva.mpg.de]
Similar packages:
Short Read Aligner/Mapper from MPG
Anfo is a mapper in the spirit of Soap/Maq/Bowtie, but its implementation takes more after BLAST/BLAT. It's most useful for the alignment of sequencing reads where the DNA sequence is somehow modified (think ancient DNA or bisulphite treatment) and/or there is more divergence between sample and reference than what fast mappers will handle gracefully (say the reference genome is missing and a related species is used instead).
Інші пакунки пов'язані з anfo
|
|
|
|
-
- dep: libanfo0 (>= 0.98)
- Library for Short Read Aligner/Mapper from MPG
-
- dep: libbz2-1.0 [sparc64]
- Стискання файлів за алгоритмом Барроуза-Уїлера — виконавчий модуль
-
- dep: libc6 (>= 2.27) [riscv64]
- Бібліотека GNU C: спільні бібліотеки
also a virtual package provided by libc6-udeb
- dep: libc6 (>= 2.29) [not alpha, ia64, riscv64, sh4]
- dep: libc6 (>= 2.32) [sh4]
-
- dep: libc6.1 (>= 2.29) [alpha]
- Бібліотека GNU C: спільні бібліотеки
also a virtual package provided by libc6.1-udeb
- dep: libc6.1 (>= 2.32) [ia64]
-
- dep: libelk0
- implementation of Scheme (the Extension Language Kit)
-
- dep: libgcc-s1 (>= 3.0) [amd64, arm64, mips64el, ppc64, ppc64el, s390x, x32]
- Допоміжна бібліотека GCC
- dep: libgcc-s1 (>= 3.4) [alpha, riscv64, sh4, sparc64]
- dep: libgcc-s1 (>= 3.5) [armel, armhf]
- dep: libgcc-s1 (>= 4.2) [i386, ia64]
-
- dep: libgcc-s2 (>= 4.2.1) [m68k]
- Допоміжна бібліотека GCC
-
- dep: libgcc-s4 (>= 4.1.1) [hppa]
- Допоміжна бібліотека GCC
-
- dep: libpopt0 (>= 1.14)
- Бібліотека для розбору параметрів командного рядка
-
- dep: libprotobuf17 [ia64]
- Бібліотека буферів протоколів на Сі++
-
- dep: libprotobuf23 (>= 3.12.4) [not ia64]
- Бібліотека буферів протоколів на Сі++
-
- dep: libstdc++6 (>= 9)
- Стандартна бібліотека C++ GNU, версії 3
-
- dep: libunwind8 [ia64]
- library to determine the call-chain of a program - runtime
-
- dep: zlib1g (>= 1:1.1.4)
- Бібліотека стискання даних (виконавчий модуль)
Завантажити anfo
| Архітектура | Розмір пакунка | Розмір після встановлення | Файли |
|---|---|---|---|
| alpha (unofficial port) | 113.7 kB | 446.0 kB | [список файлів] |
| amd64 | 113.9 kB | 439.0 kB | [список файлів] |
| arm64 | 105.0 kB | 395.0 kB | [список файлів] |
| armel | 100.0 kB | 345.0 kB | [список файлів] |
| armhf | 101.9 kB | 305.0 kB | [список файлів] |
| hppa (unofficial port) | 115.0 kB | 387.0 kB | [список файлів] |
| i386 | 119.5 kB | 413.0 kB | [список файлів] |
| ia64 (unofficial port) | 135.6 kB | 620.0 kB | [список файлів] |
| m68k (unofficial port) | 113.7 kB | 405.0 kB | [список файлів] |
| mips64el | 109.6 kB | 438.0 kB | [список файлів] |
| ppc64 (unofficial port) | 115.0 kB | 619.0 kB | [список файлів] |
| ppc64el | 114.9 kB | 619.0 kB | [список файлів] |
| riscv64 (unofficial port) | 109.9 kB | 361.0 kB | [список файлів] |
| s390x | 104.1 kB | 411.0 kB | [список файлів] |
| sh4 (unofficial port) | 125.5 kB | 383.0 kB | [список файлів] |
| sparc64 (unofficial port) | 100.0 kB | 418.0 kB | [список файлів] |
| x32 (unofficial port) | 113.9 kB | 389.0 kB | [список файлів] |