[ Pakiet źródłowy: pbsuite ]
Pakiet: pbhoney (15.8.24+dfsg-7)
Odnośniki dla pbhoney
Zasoby systemu Debian:
- Raporty o błędach
- Developer Information
- Dziennik zmian w systemie Debian
- Informacje nt. praw autorskich
- Śledzenie łatek systemu Debian
Pobieranie pakietu źródłowego pbsuite:
- [pbsuite_15.8.24+dfsg-7.dsc]
- [pbsuite_15.8.24+dfsg.orig.tar.xz]
- [pbsuite_15.8.24+dfsg-7.debian.tar.xz]
Opiekunowie:
Zasoby zewnętrzne:
- Strona internetowa [sourceforge.net]
Podobne pakiety:
genomic structural variation discovery
PBHoney is an implementation of two variant-identification approaches designed to exploit the high mappability of long reads (i.e., greater than 10,000 bp). PBHoney considers both intra-read discordance and soft-clipped tails of long reads to identify structural variants.
PBHoney is part of the PBSuite.
Inne pakiety związane z pbhoney
|
|
|
|
-
- dep: blasr
- mapping single-molecule sequencing reads
-
- dep: python3
- Interaktywny, wysokopoziomowy i obiektowy język programowania (domyślna wersja Python 3)
-
- dep: python3-h5py
- general-purpose Python interface to hdf5
-
- dep: python3-intervaltree-bio
- Interval tree convenience classes for genomic data -- Python 3 library
-
- dep: python3-networkx
- tool to create, manipulate and study complex networks (Python3)
-
- dep: python3-numpy
- Szybkie zarządzanie tablicami w języku Python (Python 3)
-
- dep: python3-pbbanana (= 15.8.24+dfsg-7)
- additional utilities for the pbsuite
-
- dep: python3-pbsuite-utils (= 15.8.24+dfsg-7)
- software for Pacific Biosciences sequencing data -- Python utilities
-
- dep: python3-pysam
- interface for the SAM/BAM sequence alignment and mapping format (Python 3)
-
- dep: samtools
- Przetwarzanie dopasowań sekwencji w formatach SAM, BAM i CRAM
-
- rec: pbdagcon
- sequence consensus using directed acyclic graphs
Pobieranie pbhoney
| Architektura | Rozmiar pakietu | Rozmiar po instalacji | Pliki |
|---|---|---|---|
| all | 1 031,7 KiB | 3 809,0 KiB | [lista plików] |