Pakiet: pbhoney (15.8.24+dfsg-3)

Odnośniki dla pbhoney

Zasoby systemu Debian:

Pobieranie pakietu źródłowego pbsuite:

Opiekunowie:

Zasoby zewnętrzne:

Strona internetowa [sourceforge.net]

Podobne pakiety:

genomic structural variation discovery

PBHoney is an implementation of two variant-identification approaches designed to exploit the high mappability of long reads (i.e., greater than 10,000 bp). PBHoney considers both intra-read discordance and soft-clipped tails of long reads to identify structural variants.

PBHoney is part of the PBSuite.

Inne pakiety związane z pbhoney

wymaga

poleca

sugeruje

enhances

dep: blasr (>= 5.3)

mapping single-molecule sequencing reads
dep: python

Interaktywny, wysokopoziomowy język obiektowy (wersja Python2)
dep: python-h5py

general-purpose Python interface to hdf5 (Python 2)
dep: python-intervaltree-bio

Interval tree convenience classes for genomic data -- Python 2 library
dep: python-networkx

tool to create, manipulate and study complex networks
dep: python-numpy

Szybkie dodawanie obiektów tablicy, moduł do języka Python
dep: python-pbbanana (= 15.8.24+dfsg-3)

additional utilities for the pbsuite
dep: python-pbsuite-utils (= 15.8.24+dfsg-3)

software for Pacific Biosciences sequencing data -- Python utilities
dep: python-pysam (>= 0.8.0)

interface for the SAM/BAM sequence alignment and mapping format (Python 2)
dep: samtools

Przetwarzanie dopasowań sekwencji w formatach SAM, BAM i CRAM

rec: pbdagcon

sequence consensus using directed acyclic graphs

Pobieranie pbhoney

Pobierz dla wszystkich dostępnych architektur
Architektura	Rozmiar pakietu	Rozmiar po instalacji	Pliki
all	1 280,3 KiB	2 356,0 KiB	[lista plików]