[ Pakiet źródłowy: r-bioc-genomicalignments ]
Pakiet: r-bioc-genomicalignments (1.38.2-1 i inne)
Odnośniki dla r-bioc-genomicalignments
Zasoby systemu Debian:
- Raporty o błędach
- Developer Information
- Dziennik zmian w systemie Debian
- Informacje nt. praw autorskich
- Śledzenie łatek systemu Debian
Pobieranie pakietu źródłowego r-bioc-genomicalignments:
- [r-bioc-genomicalignments_1.38.2-1.dsc]
- [r-bioc-genomicalignments_1.38.2.orig.tar.gz]
- [r-bioc-genomicalignments_1.38.2-1.debian.tar.xz]
Opiekunowie:
Zasoby zewnętrzne:
- Strona internetowa [bioconductor.org]
Podobne pakiety:
BioConductor representation and manipulation of short genomic alignments
This BioConductor package provides efficient containers for storing and manipulating short genomic alignments (typically obtained by aligning short reads to a reference genome). This includes read counting, computing the coverage, junction detection, and working with the nucleotide content of the alignments.
Inne pakiety związane z r-bioc-genomicalignments
|
|
|
|
-
- dep: libc6 (>= 2.16) [x32]
- Biblioteka GNU C: biblioteki współdzielone
również pakiet wirtualny udostępniany przez libc6-udeb
- dep: libc6 (>= 2.17) [arm64, ppc64el]
- dep: libc6 (>= 2.27) [riscv64]
- dep: libc6 (>= 2.3) [hppa]
- dep: libc6 (>= 2.37) [sh4]
- dep: libc6 (>= 2.4) [amd64, m68k, mips64el, ppc64, s390x, sparc64]
-
- dep: libc6.1 (>= 2.37) [ia64]
- Biblioteka GNU C: biblioteki współdzielone
również pakiet wirtualny udostępniany przez libc6.1-udeb
- dep: libc6.1 (>= 2.4) [alpha]
-
- dep: r-api-3.4 [m68k]
- Pakiet niedostępny
-
- dep: r-api-3.5 [sparc64]
- Pakiet niedostępny
-
- dep: r-api-4.0 [nie m68k, sparc64]
- pakiet wirtualny udostępniany przez r-base-core
-
- dep: r-api-bioc-3.16 [x32]
- Pakiet niedostępny
-
- dep: r-api-bioc-3.18 [nie m68k, sparc64, x32]
- pakiet wirtualny udostępniany przez r-bioc-biocgenerics
-
- dep: r-api-bioc-3.8 [sparc64]
- Pakiet niedostępny
-
- dep: r-base-core (>= 3.4.3-1) [m68k]
- GNU R core of statistical computation and graphics system
- dep: r-base-core (>= 3.5.2-1) [sparc64]
- dep: r-base-core (>= 4.2.2.20221110-1) [x32]
-
- dep: r-bioc-biocgenerics (>= 0.15.3) [m68k, sparc64]
- generic functions for Bioconductor
- dep: r-bioc-biocgenerics (>= 0.37.0) [nie m68k, sparc64]
-
- dep: r-bioc-biocparallel
- BioConductor facilities for parallel evaluation
-
- dep: r-bioc-biostrings (>= 2.37.1) [m68k]
- GNU R string objects representing biological sequences
- dep: r-bioc-biostrings (>= 2.47.6) [sparc64]
- dep: r-bioc-biostrings (>= 2.55.7) [nie m68k, sparc64]
-
- dep: r-bioc-genomeinfodb (>= 1.13.1)
- BioConductor utilities for manipulating chromosome identifiers
-
- dep: r-bioc-genomicranges (>= 1.29.14) [m68k]
- BioConductor representation and manipulation of genomic intervals
- dep: r-bioc-genomicranges (>= 1.33.4) [sparc64]
- dep: r-bioc-genomicranges (>= 1.41.5) [nie m68k, sparc64]
-
- dep: r-bioc-iranges (>= 2.11.16) [m68k]
- GNU R low-level containers for storing sets of integer ranges
- dep: r-bioc-iranges (>= 2.15.12) [sparc64]
- dep: r-bioc-iranges (>= 2.23.9) [nie m68k, sparc64]
-
- dep: r-bioc-rsamtools (>= 1.21.4) [m68k]
- GNU R binary alignment (BAM), variant call (BCF), or tabix file import
- dep: r-bioc-rsamtools (>= 1.31.2) [nie m68k]
-
- dep: r-bioc-s4vectors (>= 0.13.13) [m68k]
- BioConductor S4 implementation of vectors and lists
- dep: r-bioc-s4vectors (>= 0.19.11) [sparc64]
- dep: r-bioc-s4vectors (>= 0.27.12) [nie m68k, sparc64]
-
- dep: r-bioc-summarizedexperiment (>= 1.5.3) [m68k]
- BioConductor assay container
- dep: r-bioc-summarizedexperiment (>= 1.9.13) [nie m68k]
-
- rec: r-bioc-shortread (>= 1.24.0)
- GNU R classes and methods for high-throughput short-read sequencing data
-
- rec: r-cran-runit
- GNU R package providing unit testing framework
-
- sug: r-bioc-biocstyle [nie m68k, sparc64]
- standard styles for vignettes and other Bioconductor documents
-
- sug: r-bioc-bsgenome
- BioConductor infrastructure for Biostrings-based genome data packages
-
- sug: r-bioc-deseq2 [nie m68k, sparc64]
- R package for RNA-Seq Differential Expression Analysis
-
- sug: r-bioc-edger [nie sparc64]
- Empirical analysis of digital gene expression data in R
-
- sug: r-bioc-genomicfeatures
- GNU R tools for making and manipulating transcript centric annotations
-
- sug: r-bioc-rtracklayer
- GNU R interface to genome browsers and their annotation tracks
-
- sug: r-bioc-shortread [nie sparc64]
- GNU R classes and methods for high-throughput short-read sequencing data
-
- sug: r-cran-runit [nie sparc64]
- GNU R package providing unit testing framework
Pobieranie r-bioc-genomicalignments
| Architektura | Wersja | Rozmiar pakietu | Rozmiar po instalacji | Pliki |
|---|---|---|---|---|
| alpha (port nieoficjalny) | 1.38.2-1 | 2 093,2 KiB | 3 020,0 KiB | [lista plików] |
| amd64 | 1.38.2-1 | 2 094,1 KiB | 2 964,0 KiB | [lista plików] |
| arm64 | 1.38.2-1 | 2 093,6 KiB | 3 020,0 KiB | [lista plików] |
| hppa (port nieoficjalny) | 1.38.2-1 | 2 092,9 KiB | 2 965,0 KiB | [lista plików] |
| ia64 (port nieoficjalny) | 1.38.2-1 | 2 095,1 KiB | 3 004,0 KiB | [lista plików] |
| m68k (port nieoficjalny) | 1.14.0-1 | 1 648,5 KiB | 2 183,0 KiB | [lista plików] |
| mips64el | 1.38.2-1 | 2 090,4 KiB | 3 026,0 KiB | [lista plików] |
| ppc64 (port nieoficjalny) | 1.38.2-1 | 2 096,4 KiB | 3 021,0 KiB | [lista plików] |
| ppc64el | 1.38.2-1 | 2 095,6 KiB | 3 020,0 KiB | [lista plików] |
| riscv64 | 1.38.2-1 | 2 094,1 KiB | 2 952,0 KiB | [lista plików] |
| s390x | 1.38.2-1 | 2 093,5 KiB | 2 964,0 KiB | [lista plików] |
| sh4 (port nieoficjalny) | 1.38.2-1 | 2 091,9 KiB | 2 955,0 KiB | [lista plików] |
| sparc64 (port nieoficjalny) | 1.18.1-1 | 2 048,6 KiB | 2 867,0 KiB | [lista plików] |
| x32 (port nieoficjalny) | 1.34.0-1 | 2 063,0 KiB | 2 904,0 KiB | [lista plików] |