Pakiet: r-bioc-genomicranges (1.58.0+dfsg-2 i inne)

Odnośniki dla r-bioc-genomicranges

Zasoby systemu Debian:

Pobieranie pakietu źródłowego r-bioc-genomicranges:

Opiekunowie:

Zasoby zewnętrzne:

Strona internetowa [bioconductor.org]

Podobne pakiety:

BioConductor representation and manipulation of genomic intervals

The ability to efficiently store genomic annotations and alignments is playing a central role when it comes to analyze high-throughput sequencing data (a.k.a. NGS data). The package defines general purpose containers for storing genomic intervals as well as more specialized containers for storing alignments against a reference genome.

Inne pakiety związane z r-bioc-genomicranges

wymaga

poleca

sugeruje

enhances

dep: libc6 (>= 2.16) [x32]

Biblioteka GNU C: biblioteki współdzielone
również pakiet wirtualny udostępniany przez libc6-udeb

dep: libc6 (>= 2.17) [arm64, ppc64el]

dep: libc6 (>= 2.27) [riscv64]

dep: libc6 (>= 2.37) [sh4]

dep: libc6 (>= 2.4) [amd64, m68k, mips64el, ppc64, s390x, sparc64]
dep: r-api-4.0

pakiet wirtualny udostępniany przez r-base-core
dep: r-api-bioc-3.18 [hppa, ia64, m68k, sh4, x32]

Pakiet niedostępny
dep: r-api-bioc-3.20 [nie hppa, ia64, m68k, sh4, x32]

pakiet wirtualny udostępniany przez r-bioc-biocgenerics
dep: r-bioc-biocgenerics (>= 0.37.0)

generic functions for Bioconductor
dep: r-bioc-genomeinfodb (>= 1.15.2)

BioConductor utilities for manipulating chromosome identifiers
dep: r-bioc-iranges (>= 2.31.2) [hppa, ia64, m68k, sh4, x32]

GNU R low-level containers for storing sets of integer ranges

dep: r-bioc-iranges (>= 2.37.1) [nie hppa, ia64, m68k, sh4, x32]
dep: r-bioc-s4vectors (>= 0.27.12)

BioConductor S4 implementation of vectors and lists
dep: r-bioc-xvector (>= 0.29.2)

BioConductor representation and manpulation of external sequences

sug: r-bioc-annotate

BioConductor annotation for microarrays
sug: r-bioc-annotationdbi

GNU R Annotation Database Interface for BioConductor
sug: r-bioc-annotationhub

GNU R client to access AnnotationHub resources
sug: r-bioc-biobase

base functions for Bioconductor
sug: r-bioc-biocstyle

standard styles for vignettes and other Bioconductor documents
sug: r-bioc-biostrings (>= 2.25.3)

GNU R string objects representing biological sequences
sug: r-bioc-bsgenome

BioConductor infrastructure for Biostrings-based genome data packages
sug: r-bioc-deseq2 [nie m68k]

R package for RNA-Seq Differential Expression Analysis
sug: r-bioc-dexseq

GNU R inference of differential exon usage in RNA-Seq
sug: r-bioc-edger

Empirical analysis of digital gene expression data in R
sug: r-bioc-genomicalignments

BioConductor representation and manipulation of short genomic alignments
sug: r-bioc-genomicfeatures

GNU R tools for making and manipulating transcript centric annotations
sug: r-bioc-gviz

Plotting data and annotation information along genomic coordinates
sug: r-bioc-keggrest

GNU R client-side REST access to KEGG
sug: r-bioc-rsamtools (>= 1.13.53)

GNU R binary alignment (BAM), variant call (BCF), or tabix file import
sug: r-bioc-rtracklayer

GNU R interface to genome browsers and their annotation tracks
sug: r-bioc-summarizedexperiment (>= 0.1.5)

BioConductor assay container
sug: r-bioc-txdbmaker [nie hppa, ia64, m68k, sh4, x32]

Tools for making TxDb objects from genomic annotations
sug: r-bioc-variantannotation

BioConductor annotation of genetic variants
sug: r-cran-digest

GNU R package for 'hash digest' of R data structures
sug: r-cran-knitr

GNU R package for dynamic report generation using Literate Programming
sug: r-cran-matrix

GNU R package of classes for dense and sparse matrices
sug: r-cran-rmarkdown

convert R markdown documents into a variety of formats
sug: r-cran-runit

GNU R package providing unit testing framework

Pobieranie r-bioc-genomicranges

Pobierz dla wszystkich dostępnych architektur
Architektura	Wersja	Rozmiar pakietu	Rozmiar po instalacji	Pliki
alpha (port nieoficjalny)	1.58.0+dfsg-2	2 042,9 KiB	2 951,0 KiB	[lista plików]
amd64	1.58.0+dfsg-2	2 043,3 KiB	2 936,0 KiB	[lista plików]
arm64	1.58.0+dfsg-2	2 043,0 KiB	2 952,0 KiB	[lista plików]
hppa (port nieoficjalny)	1.54.1+dfsg-1	1 783,6 KiB	2 790,0 KiB	[lista plików]
ia64 (port nieoficjalny)	1.54.1+dfsg-1	1 783,4 KiB	2 812,0 KiB	[lista plików]
m68k (port nieoficjalny)	1.54.1+dfsg-1	1 781,8 KiB	2 780,0 KiB	[lista plików]
mips64el	1.58.0+dfsg-2	2 041,7 KiB	2 957,0 KiB	[lista plików]
ppc64 (port nieoficjalny)	1.58.0+dfsg-2	2 044,4 KiB	3 016,0 KiB	[lista plików]
ppc64el	1.58.0+dfsg-2	2 043,2 KiB	2 952,0 KiB	[lista plików]
riscv64	1.58.0+dfsg-2	2 043,3 KiB	2 928,0 KiB	[lista plików]
s390x	1.58.0+dfsg-2	2 042,4 KiB	2 936,0 KiB	[lista plików]
sh4 (port nieoficjalny)	1.54.1+dfsg-1	1 781,9 KiB	2 804,0 KiB	[lista plików]
sparc64 (port nieoficjalny)	1.58.0+dfsg-2	2 041,0 KiB	3 912,0 KiB	[lista plików]
x32 (port nieoficjalny)	1.54.1+dfsg-1	1 784,3 KiB	2 788,0 KiB	[lista plików]