[ Pakiet źródłowy: r-bioc-genomicranges ]
Pakiet: r-bioc-genomicranges (1.56.2+dfsg-1 i inne)
Odnośniki dla r-bioc-genomicranges
Zasoby systemu Debian:
- Raporty o błędach
- Developer Information
- Dziennik zmian w systemie Debian
- Informacje nt. praw autorskich
- Śledzenie łatek systemu Debian
Pobieranie pakietu źródłowego r-bioc-genomicranges:
- [r-bioc-genomicranges_1.56.2+dfsg-1.dsc]
- [r-bioc-genomicranges_1.56.2+dfsg.orig.tar.xz]
- [r-bioc-genomicranges_1.56.2+dfsg-1.debian.tar.xz]
Opiekunowie:
Zasoby zewnętrzne:
- Strona internetowa [bioconductor.org]
Podobne pakiety:
BioConductor representation and manipulation of genomic intervals
The ability to efficiently store genomic annotations and alignments is playing a central role when it comes to analyze high-throughput sequencing data (a.k.a. NGS data). The package defines general purpose containers for storing genomic intervals as well as more specialized containers for storing alignments against a reference genome.
Inne pakiety związane z r-bioc-genomicranges
|
|
|
|
-
- dep: libc6 (>= 2.16) [x32]
- Biblioteka GNU C: biblioteki współdzielone
również pakiet wirtualny udostępniany przez libc6-udeb
- dep: libc6 (>= 2.17) [arm64, ppc64el]
- dep: libc6 (>= 2.27) [riscv64]
- dep: libc6 (>= 2.37) [sh4]
- dep: libc6 (>= 2.4) [amd64, m68k, mips64el, ppc64, s390x, sparc64]
-
- dep: r-api-4.0
- pakiet wirtualny udostępniany przez r-base-core
-
- dep: r-api-bioc-3.18 [hppa, ia64, m68k, sh4, x32]
- Pakiet niedostępny
-
- dep: r-api-bioc-3.19 [nie hppa, ia64, m68k, sh4, x32]
- pakiet wirtualny udostępniany przez r-bioc-biocgenerics
-
- dep: r-bioc-biocgenerics (>= 0.37.0)
- generic functions for Bioconductor
-
- dep: r-bioc-genomeinfodb (>= 1.15.2)
- BioConductor utilities for manipulating chromosome identifiers
-
- dep: r-bioc-iranges (>= 2.31.2) [hppa, ia64, m68k, sh4, x32]
- GNU R low-level containers for storing sets of integer ranges
- dep: r-bioc-iranges (>= 2.37.1) [nie hppa, ia64, m68k, sh4, x32]
-
- dep: r-bioc-s4vectors (>= 0.27.12)
- BioConductor S4 implementation of vectors and lists
-
- dep: r-bioc-xvector (>= 0.29.2)
- BioConductor representation and manpulation of external sequences
-
- sug: r-bioc-annotate
- BioConductor annotation for microarrays
-
- sug: r-bioc-annotationdbi
- GNU R Annotation Database Interface for BioConductor
-
- sug: r-bioc-annotationhub
- GNU R client to access AnnotationHub resources
-
- sug: r-bioc-biobase
- base functions for Bioconductor
-
- sug: r-bioc-biocstyle
- standard styles for vignettes and other Bioconductor documents
-
- sug: r-bioc-biostrings (>= 2.25.3)
- GNU R string objects representing biological sequences
-
- sug: r-bioc-bsgenome
- BioConductor infrastructure for Biostrings-based genome data packages
-
- sug: r-bioc-deseq2 [nie m68k]
- R package for RNA-Seq Differential Expression Analysis
-
- sug: r-bioc-dexseq
- GNU R inference of differential exon usage in RNA-Seq
-
- sug: r-bioc-edger
- Empirical analysis of digital gene expression data in R
-
- sug: r-bioc-genomicalignments
- BioConductor representation and manipulation of short genomic alignments
-
- sug: r-bioc-genomicfeatures
- GNU R tools for making and manipulating transcript centric annotations
-
- sug: r-bioc-gviz
- Plotting data and annotation information along genomic coordinates
-
- sug: r-bioc-keggrest
- GNU R client-side REST access to KEGG
-
- sug: r-bioc-rsamtools (>= 1.13.53)
- GNU R binary alignment (BAM), variant call (BCF), or tabix file import
-
- sug: r-bioc-rtracklayer
- GNU R interface to genome browsers and their annotation tracks
-
- sug: r-bioc-summarizedexperiment (>= 0.1.5)
- BioConductor assay container
-
- sug: r-bioc-txdbmaker [nie hppa, ia64, m68k, sh4, x32]
- Tools for making TxDb objects from genomic annotations
-
- sug: r-bioc-variantannotation
- BioConductor annotation of genetic variants
-
- sug: r-cran-digest
- GNU R package for 'hash digest' of R data structures
-
- sug: r-cran-knitr
- GNU R package for dynamic report generation using Literate Programming
-
- sug: r-cran-matrix
- GNU R package of classes for dense and sparse matrices
-
- sug: r-cran-rmarkdown
- convert R markdown documents into a variety of formats
-
- sug: r-cran-runit
- GNU R package providing unit testing framework
Pobieranie r-bioc-genomicranges
| Architektura | Wersja | Rozmiar pakietu | Rozmiar po instalacji | Pliki |
|---|---|---|---|---|
| alpha (port nieoficjalny) | 1.56.2+dfsg-1 | 1 799,7 KiB | 2 821,0 KiB | [lista plików] |
| amd64 | 1.56.2+dfsg-1 | 1 800,0 KiB | 2 806,0 KiB | [lista plików] |
| arm64 | 1.56.2+dfsg-1 | 1 799,7 KiB | 2 822,0 KiB | [lista plików] |
| hppa (port nieoficjalny) | 1.54.1+dfsg-1 | 1 783,6 KiB | 2 790,0 KiB | [lista plików] |
| ia64 (port nieoficjalny) | 1.54.1+dfsg-1 | 1 783,4 KiB | 2 812,0 KiB | [lista plików] |
| m68k (port nieoficjalny) | 1.54.1+dfsg-1 | 1 781,8 KiB | 2 780,0 KiB | [lista plików] |
| mips64el | 1.56.2+dfsg-1 | 1 797,5 KiB | 2 827,0 KiB | [lista plików] |
| ppc64 (port nieoficjalny) | 1.56.2+dfsg-1 | 1 800,9 KiB | 2 886,0 KiB | [lista plików] |
| ppc64el | 1.56.2+dfsg-1 | 1 799,9 KiB | 2 822,0 KiB | [lista plików] |
| riscv64 | 1.56.2+dfsg-1 | 1 799,9 KiB | 2 798,0 KiB | [lista plików] |
| s390x | 1.56.2+dfsg-1 | 1 799,1 KiB | 2 806,0 KiB | [lista plików] |
| sh4 (port nieoficjalny) | 1.54.1+dfsg-1 | 1 781,9 KiB | 2 804,0 KiB | [lista plików] |
| sparc64 (port nieoficjalny) | 1.56.2+dfsg-1 | 1 797,5 KiB | 3 782,0 KiB | [lista plików] |
| x32 (port nieoficjalny) | 1.54.1+dfsg-1 | 1 784,3 KiB | 2 788,0 KiB | [lista plików] |