Pakiet: damapper (0.0+git20210330.ab45103-2)

Odnośniki dla damapper

Zasoby systemu Debian:

Pobieranie pakietu źródłowego damapper:

Opiekunowie:

Zasoby zewnętrzne:

Strona internetowa [github.com]

Podobne pakiety:

long read to reference genome mapping tool

Recognised as the Damapper Library, this is a long read to reference genome mapping command line tool.

For a given reference database 'X' and read block 'Y', damapper produces the single file 'Y.X.las'. Each output file is sorted in order of the A-reads, and if a match is a chain of local alignments, then the LA's in the chain occur in increasing order of A-coordinates.

HPC.damapper writes a UNIX shell script to the standard output that maps every read in blocks <first> to <last> of database <reads> to a reference sequence <ref>. If <last> is missing then only the single block <first> is mapped, and if <first> is also missing then all blocks of the database are mapped.

This package contains the damapper and HPC.damapper binaries.

Inne pakiety związane z damapper

wymaga

poleca

sugeruje

enhances

dep: libc6 (>= 2.34) [nie alpha, ia64, sh4]

Biblioteka GNU C: biblioteki współdzielone
również pakiet wirtualny udostępniany przez libc6-udeb

dep: libc6 (>= 2.37) [sh4]
dep: libc6.1 (>= 2.34) [alpha]

Biblioteka GNU C: biblioteki współdzielone
również pakiet wirtualny udostępniany przez libc6.1-udeb

dep: libc6.1 (>= 2.37) [ia64]

Pobieranie damapper

Pobierz dla wszystkich dostępnych architektur
Architektura	Rozmiar pakietu	Rozmiar po instalacji	Pliki
alpha (port nieoficjalny)	101,9 KiB	428,0 KiB	[lista plików]
amd64	106,8 KiB	308,0 KiB	[lista plików]
arm64	95,0 KiB	364,0 KiB	[lista plików]
armel	96,4 KiB	298,0 KiB	[lista plików]
armhf	95,3 KiB	222,0 KiB	[lista plików]
hppa (port nieoficjalny)	103,0 KiB	308,0 KiB	[lista plików]
i386	107,0 KiB	342,0 KiB	[lista plików]
ia64 (port nieoficjalny)	128,4 KiB	549,0 KiB	[lista plików]
m68k (port nieoficjalny)	94,2 KiB	298,0 KiB	[lista plików]
mips64el	96,5 KiB	373,0 KiB	[lista plików]
ppc64 (port nieoficjalny)	108,7 KiB	428,0 KiB	[lista plików]
ppc64el	109,9 KiB	428,0 KiB	[lista plików]
riscv64	105,2 KiB	244,0 KiB	[lista plików]
s390x	113,0 KiB	328,0 KiB	[lista plików]
sh4 (port nieoficjalny)	118,5 KiB	298,0 KiB	[lista plików]
sparc64 (port nieoficjalny)	94,3 KiB	2 095,0 KiB	[lista plików]
x32 (port nieoficjalny)	104,0 KiB	290,0 KiB	[lista plików]