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パッケージ: damapper (0.0+git20210330.ab45103-2)

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long read to reference genome mapping tool

Recognised as the Damapper Library, this is a long read to reference genome mapping command line tool.

For a given reference database 'X' and read block 'Y', damapper produces the single file 'Y.X.las'. Each output file is sorted in order of the A-reads, and if a match is a chain of local alignments, then the LA's in the chain occur in increasing order of A-coordinates.

HPC.damapper writes a UNIX shell script to the standard output that maps every read in blocks <first> to <last> of database <reads> to a reference sequence <ref>. If <last> is missing then only the single block <first> is mapped, and if <first> is also missing then all blocks of the database are mapped.

This package contains the damapper and HPC.damapper binaries.

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i386 107.0 kB342.0 kB [ファイル一覧]
ia64 (非公式の移植版) 128.4 kB549.0 kB [ファイル一覧]
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ppc64el 109.9 kB428.0 kB [ファイル一覧]
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s390x 113.0 kB328.0 kB [ファイル一覧]
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