Pakiet: samtools (1.20-3)

Odnośniki dla samtools

Zasoby systemu Debian:

Pobieranie pakietu źródłowego samtools:

Opiekunowie:

Zasoby zewnętrzne:

Strona internetowa [www.htslib.org]

Podobne pakiety:

Przetwarzanie dopasowań sekwencji w formatach SAM, BAM i CRAM

Samtools to zestaw narzędzi zarządzających dopasowaniami sekwencji nukleotydów w binarnym formacie BAM. Importuje i eksportuje do formatów ascii SAM (Sequence Alignment/Map) i CRAM, sortuje, łączy i indeksuje, a także umożliwia szybkie pobieranie odczytów z dowolnych regionów. Został zaprojektowany do pracy na strumieniu i może otwierać plik BAM lub CRAM (ale nie w formacie SAM) na zdalnym serwerze FTP lub HTTP.

Znaczniki: Dziedzina: Biologia, Bioinformatyka, Zaimplementowane w: implemented-in::c, interface::commandline, Sieć: Klient, Protokół sieciowy: FTP, protocol::http, role::program, Zakres: Narzędzie, Pakiet narzędziowy interfejsu: Ncurses (terminalowy), Przeznaczenie: use::analysing, use::calculating, Filtrowanie, Działa z: Sekwencje biologiczne

Inne pakiety związane z samtools

wymaga

poleca

sugeruje

enhances

dep: libc6 (>= 2.34)

Biblioteka GNU C: biblioteki współdzielone
również pakiet wirtualny udostępniany przez libc6-udeb
dep: libhts3t64 (>= 1.20~)

C library for high-throughput sequencing data formats
dep: libncurses6 (>= 6)

Biblioteki współdzielone przeznaczone do obsługi terminala
dep: libtinfo6 (>= 6)

Współdzielona, niskopoziomowa biblioteka terminfo do obsługi terminala
dep: zlib1g (>= 1:1.2.3.3)

Biblioteka kompresyjna - pliki wykonawcze

sug: cwltool

Common Workflow Language reference implementation

Pobieranie samtools

Pobierz dla wszystkich dostępnych architektur
Architektura	Rozmiar pakietu	Rozmiar po instalacji	Pliki
armel	601,7 KiB	1 330,0 KiB	[lista plików]