Pakiet: pbalign (0.3.2-1)

Odnośniki dla pbalign

Zasoby systemu Debian:

Pobieranie pakietu źródłowego pbalign:

Opiekunowie:

Zasoby zewnętrzne:

Strona internetowa [github.com]

Podobne pakiety:

map Pacific Biosciences reads to reference DNA sequences

pbalign aligns PacBio reads to reference sequences, filters aligned reads according to user-specific filtering criteria, and converts the output to either the SAM format or PacBio Compare HDF5 (e.g., .cmp.h5) format.

This package is part of the SMRTAnalysis suite.

Inne pakiety związane z pbalign

wymaga

poleca

sugeruje

enhances

dep: blasr (>= 5.3+0)

mapping single-molecule sequencing reads
dep: python

Interaktywny, wysokopoziomowy język obiektowy (wersja Python2)
dep: python-pbalign (= 0.3.2-1)

map Pacific Biosciences reads to reference DNA sequences (Python2)
dep: python-pkg-resources

Wykrywanie pakietów i udostępnianie zasobów przy użyciu pkg_resources

rec: hdf5-tools

Hierarchiczny Format Danych (HDF5) - narzędzia uruchomieniowe
rec: python-pbh5tools

tools for manipulating Pacific Biosciences HDF5 files -- Python 2 library

sug: bowtie2

ultrafast memory-efficient short read aligner
sug: gmap

Dopasowanie splicingowe i tolerancyjne SNP dla mRNA i krótkich odczytów
sug: pbalign-doc

documentation for pbalign

Pobieranie pbalign

Pobierz dla wszystkich dostępnych architektur
Architektura	Rozmiar pakietu	Rozmiar po instalacji	Pliki
all	9,3 KiB	44,0 KiB	[lista plików]