[ buster ]
[ Source: pbalign ]
Package: pbalign (0.3.2-1)
Links for pbalign
Debian Resources:
Download Source Package pbalign:
Maintainers:
External Resources:
- Homepage [github.com]
Similar packages:
Oversæt Pacific Biosciences-læsninger til DNA-sekvenser med reference
Pbalign sammenligner PacBio-læsninger med referencesekvenser, filtrerer sammenlignede læsninger jævnfør brugerspecifikke filtreringskriterier og konverterer resultatet til enten SAM-formatet eller PacBio Compare HDF5- formatet (f.eks., .cmp.h5).
Denne pakke er en del af SMRTAnalysis-programpakken.
Other Packages Related to pbalign
|
|
|
|
-
- dep: blasr (>= 5.3+0)
- Kortlægning af enkelte molekylesekventeringslæsninger
-
- dep: python
- Interaktivt objektorienteret sprog på højt niveau - Python 2-version
-
- dep: python-pbalign (= 0.3.2-1)
- map Pacific Biosciences reads to reference DNA sequences (Python2)
-
- dep: python-pkg-resources
- Pakkesøgning og ressourceadgang med brug af pkg_resources
-
- rec: hdf5-tools
- Hierarchical Data Format 5 (HDF5) - Kørselstidsværktøjer
-
- rec: python-pbh5tools
- tools for manipulating Pacific Biosciences HDF5 files -- Python 2 library
-
- sug: bowtie2
- Ultrahurtig og hukommelseseffektiv short read-sammenligner
-
- sug: gmap
- Opdelt og SNP-overholdende justering for mRNA og korte læsninger
-
- sug: pbalign-doc
- Dokumentation for pbalign
Download pbalign
| Architecture | Package Size | Installed Size | Files |
|---|---|---|---|
| all | 9.3 kB | 44.0 kB | [list of files] |