[ Pakiet źródłowy: unicycler ]
Pakiet: unicycler (0.4.8+dfsg-2)
Odnośniki dla unicycler
Zasoby systemu Debian:
- Raporty o błędach
- Developer Information
- Dziennik zmian w systemie Debian
- Informacje nt. praw autorskich
- Śledzenie łatek systemu Debian
Pobieranie pakietu źródłowego unicycler:
- [unicycler_0.4.8+dfsg-2.dsc]
- [unicycler_0.4.8+dfsg.orig.tar.xz]
- [unicycler_0.4.8+dfsg-2.debian.tar.xz]
Opiekunowie:
- Debian Med Packaging Team (Strona QA, Archiwum e-mail)
- Andreas Tille (Strona QA)
- Liubov Chuprikova (Strona QA)
Zasoby zewnętrzne:
- Strona internetowa [github.com]
Podobne pakiety:
hybrid assembly pipeline for bacterial genomes
Unicycler is an assembly pipeline for bacterial genomes. It can assemble Illumina-only read sets where it functions as a SPAdes-optimiser. It can also assembly long-read-only sets (PacBio or Nanopore) where it runs a miniasm+Racon pipeline. For the best possible assemblies, give it both Illumina reads and long reads, and it will conduct a hybrid assembly.
Inne pakiety związane z unicycler
|
|
|
|
-
- dep: bcftools
- Wywoływanie wariantów genomowych oraz zarządzanie plikami VCF i BCF
-
- dep: bowtie2
- ultrafast memory-efficient short read aligner
-
- dep: default-jre
- Standard Java or Java compatible Runtime
-
- dep: libc6 (>= 2.29)
- Biblioteka GNU C: biblioteki współdzielone
również pakiet wirtualny udostępniany przez libc6-udeb
-
- dep: libgcc1 (>= 1:3.0)
- Pakiet niedostępny
-
- dep: libstdc++6 (>= 6)
- Standardowa biblioteka GNU C++, wersja 3
-
- dep: miniasm
- ultrafast de novo assembler for long noisy DNA sequencing reads
-
- dep: ncbi-blast+
- next generation suite of BLAST sequence search tools
-
- dep: pilon
- automated genome assembly improvement and variant detection tool
-
- dep: python3
- interactive high-level object-oriented language (default python3 version)
- dep: python3 (>= 3~)
-
- dep: python3-setuptools
- Python3 Distutils Enhancements
-
- dep: racon
- consensus module for raw de novo DNA assembly of long uncorrected reads
-
- dep: samtools
- Przetwarzanie dopasowań sekwencji w formatach SAM, BAM i CRAM
-
- dep: spades (>= 3.13.1)
- genome assembler for single-cell and isolates data sets
-
- dep: zlib1g (>= 1:1.1.4)
- Biblioteka kompresyjna - pliki wykonawcze
-
- rec: unicycler-data
- hybrid assembly pipeline for bacterial genomes (data package)
Pobieranie unicycler
| Architektura | Rozmiar pakietu | Rozmiar po instalacji | Pliki |
|---|---|---|---|
| amd64 | 861,0 KiB | 3 532,0 KiB | [lista plików] |