Pakiet: cufflinks (2.2.1+dfsg.1-8 i inne) [non-free]

Odnośniki dla cufflinks

Zasoby systemu Debian:

Pobieranie pakietu źródłowego cufflinks:

Opiekunowie:

Zasoby zewnętrzne:

Strona internetowa [cufflinks.cbcb.umd.edu]

Podobne pakiety:

Transcript assembly, differential expression and regulation for RNA-Seq

Cufflinks assembles transcripts, estimates their abundances, and tests for differential expression and regulation in RNA-Seq samples. It accepts aligned RNA-Seq reads and assembles the alignments into a parsimonious set of transcripts. Cufflinks then estimates the relative abundances of these transcripts based on how many reads support each one.

Znaczniki: Biologia: Kwasy nukleinowe, Dziedzina: Biologia, field::biology:bioinformatics, implemented-in::c++, Rola: Program, Działa z: Sekwencje biologiczne

Inne pakiety związane z cufflinks

wymaga

poleca

sugeruje

enhances

dep: libboost-serialization1.74.0 (>= 1.74.0)

serialization library for C++
dep: libboost-thread1.74.0 (>= 1.74.0)

portable C++ multi-threading
dep: libc6 (>= 2.29)

Biblioteka GNU C: biblioteki współdzielone
również pakiet wirtualny udostępniany przez libc6-udeb
dep: libgcc-s1 (>= 4.2)

Biblioteka wspomagająca GCC
dep: libstdc++6 (>= 5.2)

Standardowa biblioteka GNU C++, wersja 3
dep: python3

interactive high-level object-oriented language (default python3 version)
dep: zlib1g (>= 1:1.2.3.3)

Biblioteka kompresyjna - pliki wykonawcze

rec: gffread

Konwertowanie formatu GFF/GTF, filtrowanie regionów, ekstrakcja sekwencji FASTA

enh: tophat

Pakiet niedostępny

Pobieranie cufflinks

Pobierz dla wszystkich dostępnych architektur
Architektura	Wersja	Rozmiar pakietu	Rozmiar po instalacji	Pliki
ppc64el	2.2.1+dfsg.1-8+b1	1 549,2 KiB	13 797,0 KiB	[lista plików]