Pakiet: grabix (0.1.7-2)

Odnośniki dla grabix

Zasoby systemu Debian:

Pobieranie pakietu źródłowego grabix:

Opiekunowie:

Zasoby zewnętrzne:

Strona internetowa [github.com]

Podobne pakiety:

wee tool for random access into BGZF files

In biomedical research it is increasing practice to study the genetic basis of disease. This now frequently comprises the sequencing of human sequences. The output of the machine however is redundant, and the real sequence is the best sequence to explain the redundancy. The exchange of data happens only with compressed files - to huge and redundant to perform otherwise. One should avoid uncompression whenever possible.

grabix leverages the fantastic BGZF library of the samtools package to provide random access into text files that have been compressed with bgzip. grabix creates it's own index (.gbi) of the bgzipped file. Once indexed, one can extract arbitrary lines from the file with the grab command. Or choose random lines with the, well, random command.

Inne pakiety związane z grabix

wymaga

poleca

sugeruje

enhances

dep: libc6 (>= 2.14) [amd64]

Biblioteka GNU C: biblioteki współdzielone
również pakiet wirtualny udostępniany przez libc6-udeb

dep: libc6 (>= 2.17) [arm64, ppc64el]

dep: libc6 (>= 2.4) [nie amd64, arm64, ppc64el]
dep: libgcc1 (>= 1:3.3.1) [nie armel, armhf]

Pakiet niedostępny

dep: libgcc1 (>= 1:3.5) [armel, armhf]
dep: libstdc++6 (>= 5.2)

Standardowa biblioteka GNU C++, wersja 3
dep: tabix

Narzędzie do indeksowania plików z tabulacjami rozdzielającymi pozycje genomu
dep: zlib1g (>= 1:1.2.0)

Biblioteka kompresyjna - pliki wykonawcze

Pobieranie grabix

Pobierz dla wszystkich dostępnych architektur
Architektura	Rozmiar pakietu	Rozmiar po instalacji	Pliki
amd64	14,4 KiB	56,0 KiB	[lista plików]
arm64	13,9 KiB	52,0 KiB	[lista plików]
armel	15,0 KiB	51,0 KiB	[lista plików]
armhf	14,4 KiB	43,0 KiB	[lista plików]
i386	15,8 KiB	55,0 KiB	[lista plików]
mips64el	15,0 KiB	53,0 KiB	[lista plików]
mipsel	16,1 KiB	52,0 KiB	[lista plików]
ppc64el	14,9 KiB	92,0 KiB	[lista plików]