Pakiet: exonerate (2.4.0-5)

Odnośniki dla exonerate

Zasoby systemu Debian:

Pobieranie pakietu źródłowego exonerate:

Opiekunowie:

Zasoby zewnętrzne:

Strona internetowa [www.ebi.ac.uk]

Podobne pakiety:

generic tool for pairwise sequence comparison

Exonerate allows you to align sequences using a many alignment models, using either exhaustive dynamic programming, or a variety of heuristics. Much of the functionality of the Wise dynamic programming suite was reimplemented in C for better efficiency. Exonerate is an intrinsic component of the building of the Ensembl genome databases, providing similarity scores between RNA and DNA sequences and thus determining splice variants and coding sequences in general.

An In-silico PCR Experiment Simulation System (see the ipcress man page) is packaged with exonerate.

This package also comes with a selection of utilities for performing simple manipulations quickly on fasta files beyond 2Gb

Znaczniki: Dziedzina: Biologia, Bioinformatyka, Zaimplementowane w: implemented-in::c, interface::commandline, Rola: Program, Zakres: Narzędzie, Przeznaczenie: use::TODO, use::searching, Obsługa formatu: Wymaga dodatkowego znacznika, works-with-format::plaintext, works-with::TODO

Inne pakiety związane z exonerate

wymaga

poleca

sugeruje

enhances

dep: libc6 (>= 2.29)

Biblioteka GNU C: biblioteki współdzielone
również pakiet wirtualny udostępniany przez libc6-udeb
dep: libglib2.0-0 (>= 2.24.0)

Glib, biblioteka funkcji języka C

sug: wise

comparison of biopolymers, like DNA and protein sequences

enh: bioperl-run

Nakładki na BioPerl: skrypty

Pobieranie exonerate

Pobierz dla wszystkich dostępnych architektur
Architektura	Rozmiar pakietu	Rozmiar po instalacji	Pliki
amd64	1 578,1 KiB	8 240,0 KiB	[lista plików]
arm64	1 405,5 KiB	7 956,0 KiB	[lista plików]
armel	1 283,0 KiB	7 795,0 KiB	[lista plików]
armhf	1 358,2 KiB	5 467,0 KiB	[lista plików]
i386	1 708,4 KiB	8 867,0 KiB	[lista plików]
mips64el	1 430,4 KiB	9 143,0 KiB	[lista plików]
mipsel	1 403,0 KiB	8 592,0 KiB	[lista plików]
ppc64el	1 500,0 KiB	11 188,0 KiB	[lista plików]
s390x	1 446,3 KiB	9 768,0 KiB	[lista plików]