Pakket: python3-cyvcf2 (0.30.4-4)

Verwijzigingen voor python3-cyvcf2

Debian bronnen:

Het bronpakket cyvcf2 downloaden:

Beheerders:

Externe bronnen:

Homepage [github.com]

Vergelijkbare pakketten:

VCF parser based on htslib (Python 3)

This modules allows fast parsing of VCF and BCF including region-queries with Python. This is essential for efficient analyses of nucleotide variation with Python on high-throughput sequencing data.

cyvcf2 is a cython wrapper around htslib. Attributes like variant.gt_ref_depths return a numpy array directly so they are immediately ready for downstream use.

This package installs the library for Python 3.

Andere aan python3-cyvcf2 gerelateerde pakketten

depends

recommends

suggests

enhances

dep: libc6 (>= 2.14) [amd64]

GNU C Bibliotheek: Gedeelde bibliotheken
Ook een virtueel pakket geboden door: libc6-udeb

dep: libc6 (>= 2.17) [arm64, ppc64el]

dep: libc6 (>= 2.7) [niet amd64, arm64, ppc64el]
dep: libhts3 (>= 1.10)

C library for high-throughput sequencing data formats
dep: python3

interactive high-level object-oriented language (default python3 version)

dep: python3 (<< 3.10)

dep: python3 (>= 3.9~)
dep: python3-click

Wrapper around optparse for command line utilities - Python 3.x
dep: python3-coloredlogs

colored terminal output for Python 3's logging module
dep: python3-numpy (>= 1:1.16.0~rc1)

Fast array facility to the Python 3 language
dep: python3-numpy-abi9

virtueel pakket geboden door python3-numpy

python3-cyvcf2 downloaden

Pakket downloaden voor alle beschikbare platforms
Platform	Pakketgrootte	Geïnstalleerde grootte	Bestanden
amd64	787,7 kB	4.755,0 kB	[overzicht]
arm64	758,6 kB	4.694,0 kB	[overzicht]
armel	758,7 kB	4.662,0 kB	[overzicht]
armhf	759,8 kB	4.482,0 kB	[overzicht]
i386	787,5 kB	4.779,0 kB	[overzicht]
mips64el	742,9 kB	4.773,0 kB	[overzicht]
mipsel	743,9 kB	4.724,0 kB	[overzicht]
ppc64el	787,2 kB	4.870,0 kB	[overzicht]
s390x	751,4 kB	4.749,0 kB	[overzicht]