パッケージ: vt (0.57721+ds-3 など)

vt に関するリンク

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vt ソースパッケージをダウンロード:

メンテナ:

外部の資源:

ホームページ [genome.sph.umich.edu]

類似のパッケージ:

toolset for short variant discovery in genetic sequence data

vt is a variant tool set that discovers short variants from Next Generation Sequencing data.

Vt-normalize is a tool to normalize representation of genetic variants in the VCF. Variant normalization is formally defined as the consistent representation of genetic variants in an unambiguous and concise way. In vt a simple general algorithm to enforce this is implemented.

その他の vt 関連パッケージ

依存

推奨

提案

enhances

dep: libc6 (>= 2.34)

GNU C ライブラリ: 共有ライブラリ
以下のパッケージによって提供される仮想パッケージでもあります: libc6-udeb
dep: libgcc-s1 (>= 3.0) [armel, armhf 以外]

GCC 共有ライブラリ

dep: libgcc-s1 (>= 3.5) [armel, armhf]
dep: libhts3t64 (>= 1.17)

C library for high-throughput sequencing data formats
dep: libpcre2-8-0 (>= 10.22)

新しい Perl 互換正規表現ライブラリ - 8 ビットランタイムファイル
dep: libstdc++6 (>= 13.1)

GNU 標準 C++ ライブラリ v3
dep: r-base-core

GNU R core of statistical computation and graphics system

vt のダウンロード

すべての利用可能アーキテクチャ向けのダウンロード
アーキテクチャ	バージョン	パッケージサイズ	インストールサイズ	ファイル
amd64	0.57721+ds-3+b1	821.5 kB	2,902.0 kB	[ファイル一覧]
arm64	0.57721+ds-3+b1	667.7 kB	2,578.0 kB	[ファイル一覧]
armel	0.57721+ds-3+b1	637.2 kB	2,361.0 kB	[ファイル一覧]
armhf	0.57721+ds-3+b1	657.9 kB	1,661.0 kB	[ファイル一覧]
i386	0.57721+ds-3+b1	826.5 kB	3,065.0 kB	[ファイル一覧]
mips64el	0.57721+ds-3+b1	604.5 kB	3,505.0 kB	[ファイル一覧]
ppc64el	0.57721+ds-3+b1	726.7 kB	3,090.0 kB	[ファイル一覧]
s390x	0.57721+ds-3+b1	757.8 kB	2,834.0 kB	[ファイル一覧]