Paketti: vt (0.57721+ds-3 ja muut)

Links for vt

Debian-palvelut:

Imuroi lähdekoodipaketti vt:

Ylläpitäjät:

External Resources:

Kotisivu [genome.sph.umich.edu]

Samankaltaisia paketteja:

toolset for short variant discovery in genetic sequence data

vt is a variant tool set that discovers short variants from Next Generation Sequencing data.

Vt-normalize is a tool to normalize representation of genetic variants in the VCF. Variant normalization is formally defined as the consistent representation of genetic variants in an unambiguous and concise way. In vt a simple general algorithm to enforce this is implemented.

Muut pakettiin vt liittyvät paketit

depends

recommends

suggests

enhances

dep: libc6 (>= 2.34)

GNU-C-kirjasto: jaetut kirjastot
myös näennäispaketti, jonka toteuttaa libc6-udeb
dep: libgcc-s1 (>= 3.0) [ei armel, armhf, riscv64]

GCC:n apukirjasto

dep: libgcc-s1 (>= 3.4) [riscv64]

dep: libgcc-s1 (>= 3.5) [armel, armhf]
dep: libhts3t64 (>= 1.17)

C library for high-throughput sequencing data formats
dep: libpcre2-8-0 (>= 10.22)

New Perl Compatible Regular Expression Library- 8 bit runtime files
dep: libstdc++6 (>= 13.1)

GNU standardi C++ -kirjasto, versio 3
dep: r-base-core

GNU R core of statistical computation and graphics system

Imuroi vt

Imurointi kaikille saataville arkkitehtuureille
Arkkitehtuuri	Versio	Paketin koko	Koko asennettuna	Tiedostot
amd64	0.57721+ds-3+b1	821.5 kt	2,902.0 kt	[tiedostoluettelo]
arm64	0.57721+ds-3+b1	667.7 kt	2,578.0 kt	[tiedostoluettelo]
armel	0.57721+ds-3+b1	637.2 kt	2,361.0 kt	[tiedostoluettelo]
armhf	0.57721+ds-3+b1	657.9 kt	1,661.0 kt	[tiedostoluettelo]
i386	0.57721+ds-3+b1	826.5 kt	3,065.0 kt	[tiedostoluettelo]
mips64el	0.57721+ds-3+b1	604.5 kt	3,505.0 kt	[tiedostoluettelo]
ppc64el	0.57721+ds-3+b1	726.7 kt	3,090.0 kt	[tiedostoluettelo]
riscv64	0.57721+ds-3+b2	803.1 kt	2,342.0 kt	[tiedostoluettelo]
s390x	0.57721+ds-3+b1	757.8 kt	2,834.0 kt	[tiedostoluettelo]