[ ソース: tombo ]
パッケージ: tombo (1.5.1-6)
identification of modified nucleotides from raw nanopore sequencing data
Tombo is a suite of tools primarily for the identification of modified nucleotides from nanopore sequencing data. Tombo also provides tools for the analysis and visualization of raw nanopore signal.
その他の tombo 関連パッケージ
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- dep: libc6 (>= 2.29)
- GNU C ライブラリ: 共有ライブラリ
以下のパッケージによって提供される仮想パッケージでもあります: libc6-udeb
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- dep: libgcc-s1 (>= 3.5) [armel, armhf]
- GCC 共有ライブラリ
- dep: libgcc-s1 (>= 4.2) [i386]
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- dep: python3
- 対話式の高レベルオブジェクト指向言語 (デフォルト python3 バージョン)
- dep: python3 (<< 3.13)
- dep: python3 (>= 3.11~)
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- dep: python3-h5py
- general-purpose Python interface to hdf5
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- dep: python3-mappy
- Python3 interface minimap2
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- dep: python3-numpy (>= 1:1.22.0)
- Fast array facility to the Python language (Python 3)
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- dep: python3-numpy-abi9
- 以下のパッケージによって提供される仮想パッケージです: python3-numpy
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- dep: python3-pkg-resources
- pkg_resources を用いたパッケージ検索およびリソースアクセス
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- dep: python3-scipy
- scientific tools for Python 3
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- dep: python3-tqdm
- fast, extensible progress bar for Python 3 and CLI tool
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- rec: python3-pyfaidx
- efficient random access to fasta subsequences for Python 3
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- rec: python3-rpy2
- Python3 interface to the GNU R language and environment (version 2)
tombo のダウンロード
| アーキテクチャ | パッケージサイズ | インストールサイズ | ファイル |
|---|---|---|---|
| amd64 | 472.9 kB | 1,688.0 kB | [ファイル一覧] |
| arm64 | 450.7 kB | 1,706.0 kB | [ファイル一覧] |
| armel | 457.1 kB | 1,614.0 kB | [ファイル一覧] |
| armhf | 463.0 kB | 1,494.0 kB | [ファイル一覧] |
| i386 | 482.2 kB | 1,720.0 kB | [ファイル一覧] |
| mips64el | 445.2 kB | 1,844.0 kB | [ファイル一覧] |
| ppc64el | 465.2 kB | 1,834.0 kB | [ファイル一覧] |
| s390x | 467.1 kB | 1,686.0 kB | [ファイル一覧] |